附件31.1

主要行政人員的核證

根據2002年《薩班斯-奧克斯利法案》第302節

我約瑟夫·P·哈根，證明：

1.本人已審閲Regulus Therapeutics Inc.表格10—K年度報告；

2.據本人所知，本報告不包含任何重大事實的不實陳述或遺漏陳述作出該等陳述所需的重要事實，就本報告所涵蓋的期間而言，該等陳述並無誤導性；

3.根據本人所知，本報告中包含的財務報表和其他財務信息在所有重大方面公允地反映了註冊人截至本報告所列期間的財務狀況、經營成果和現金流量；

4.註冊人的其他認證官和我負責為註冊人建立和維護披露控制和程序（定義見交易法規則13a—15（e）和15d—15（e））以及財務報告的內部控制（定義見交易法規則13（a）—15（f）和15（d）—15（f）），並具有：

a.設計該等披露控制和程序，或促使該等披露控制和程序在吾等監督下設計，以確保有關注冊人（包括其合併子公司）的重大信息被該等實體內的其他人告知吾等，特別是在本報告編制期間；

B.設計財務報告內部控制，或使財務報告內部控制在我們的監督下設計，以合理保證財務報告的可靠性，並根據公認會計原則為外部目的編制財務報表；

C.評估了註冊人披露控制和程序的有效性，並在本報告中提出了截至本報告所涵蓋期間結束時基於此類評估的披露控制和程序的有效性的結論；以及

D.在本報告中披露在註冊人最近一個財政季度發生的註冊人財務報告內部控制的任何變更，這些變更已經或可能對註冊人財務報告內部控制造成重大影響；以及

5.註冊人的另一個核證人員和我已根據我們對財務報告內部控制的最新評估，向註冊人的審計師和註冊人董事會審計委員會（或履行同等職能的人員）披露：

a.在財務報告內部控制的設計或操作中，合理可能對註冊人記錄、處理、彙總和報告財務信息的能力產生不利影響的所有重大缺陷和重大弱點；以及

B.涉及管理層或其他在註冊人財務報告內部控制中發揮重要作用的員工的任何欺詐，無論是否重大。