附錄 99.1 Progressive Supranuclear Palsy (PSP) 投資者和分析師 電話會議 2023 年 7 月 26 日

在今天的電話會議上 • 歡迎 Amylyx 投資者 關係與傳播主管 Lindsey Allen • 開幕詞 Amylyx 聯席首席執行官 Josh Cohen 和 Justin Klee • AMX0035 PSP 中的科學理由 Amylyx 全球醫學戰略與傳播主管傑米·蒂蒙斯博士 • PSP 治療 LMU 醫院神經病學系董事 Günter Höglinger 博士，德國慕尼黑路德維希-馬克西米利安大學（LMU），PSP 中 AMX0035 ORION 3 期臨牀試驗的首席研究員 • 3 期 PSP 試驗概述 負責人 Lahar Mehta 博士全球臨牀開發，Amylyx • 問答環節 2

本演示文稿中包含的關於非歷史事實的事項 的免責聲明是經修訂的1995年《私人證券訴訟改革法》所指的 “前瞻性陳述”。由於此類陳述存在風險和不確定性，因此實際結果可能與此類前瞻性陳述所表達或暗示的結果存在重大差異。此類聲明包括但不限於關於 AMX0035 作為肌萎縮性側索硬化症治療潛力的聲明，以及公司計劃探索 將 AMX0035 用於其他神經退行性疾病，包括進行性核上性麻痺 (PSP)，以及對啟動 PSP 3 期臨牀試驗的時間和註冊地理位置的預期；對 PSP 市場規模的預期；以及對我們長期的 PSP 市場規模的預期戰略。本演示文稿中的任何前瞻性陳述均基於管理層對未來事件的當前預期，存在許多風險和 不確定性，這些風險和不確定性可能導致實際業績與此類前瞻性陳述中陳述或暗示的業績存在重大不利差異。導致前瞻性陳述不確定性的風險包括： Amylyx 項目開發活動的成功、成本和時機，包括正在進行和計劃中的臨牀試驗、Amylyx 執行其商業和監管戰略的能力、監管發展、Amylyx 為 運營提供資金的能力，以及 COVID-19 疫情可能對 Amylyx 運營產生的影響，以及風險和不確定性在 Amylyx 的美國證券交易委員會 (SEC) 文件中列出，包括 Amylyx'截至2022年12月31日止年度的10-K表年度報告，以及隨後向美國證券交易委員會提交的文件。本演示文稿中包含的所有前瞻性陳述僅代表其發表之日。Amylyx 沒有 義務更新此類聲明以反映在聲明發表之日之後發生的事件或情況。3

AMX0035 PSP 中的科學理由 Jamie Timmons 博士，全球 醫療戰略與傳播負責人，Amylyx 4

我們的使命是有朝一日結束神經退行性 疾病造成的痛苦。5

神經退行性疾病共享相互關聯、Hallmark Pathows 病理蛋白聚集肌萎縮性側索硬化症 (ALS) • TDP43、tau、SOD1、FUS、dprs tauopathies；例如，進行性核上性麻痺 (PSP) • tau 阿爾茨海默氏病 • tau，Aβ 這些途徑的相互關聯性凸顯了多途徑療法的必要性 Wilson DM 3rd 等。手機。2023 年 2 月 16 日；186 (4): 693-714。6

AMX0035（苯丁酸鈉和牛磺二醇）作用於幾種共享的 1-9 Hallmark 途徑以減少神經元細胞死亡病理性神經元細胞死亡蛋白聚集 • 體外證據表明 2 • 減少神經元中的 tau 免於死亡神經退行性 • 影響導致 病細胞和細胞死亡的關鍵途徑，包括小鼠模型和通過阿爾茨海默氏症線粒體和展開的 3-5 疾病發生的內在細胞凋亡臨牀蛋白質反應 6-9 試驗 Altered Energy Homeostasis • 穩定線粒體 膜，改善線粒體功能，增加電池 4,5 的能量產生 1。Wilson DM 3rd 等人手機。2023 年 2 月 16 日；186 (4): 693-714。2.Cohen J 等人海報發表於：第 28 屆 ALS/MND 國際研討會；2017 年 12 月 4 日至 10 日； 馬薩諸塞州波士頓。3.Zhou W. J Biol Chem. 2011；286 (17): 14941-14951。4.Rodrigues CM，Steer CJ。Expert Opin Investig Drugs。2001；10 (7): 1243-1253。5.Rodrigues CM 等人生物化學。2003；42 (10): 3070-3080。6.Ricobaraza A 等人神經心理藥理學。 2009；34 (7): 1721-1732。7.Bondulich MK 等人Brain。2016；139 (8): 2290-2306。8. van der Harg JM 等人。7 Cell Death Dis. 2014；5 (8): e1393。9.Arnold SE 等人海報發表於：第 15 屆阿爾茨海默氏病臨牀試驗；2022 年 11 月 29 日至 12 月 2 日；加利福尼亞州舊金山

PSP 是一種罕見、漸進和致命的 tauosph • 影響估計患病率的罕見神經系統 疾病：身體運動、行走和 1,2 平衡以及眼球運動。全球 100,000 人中有 7 個 • 缺乏疾病改良療法估計發病率：造成大量未得到滿足的需求。全球每100,000人中有2 0.81 • PSP 是一種與 tau 功能障礙、tau 聚集和廣泛的神經變性相關的同義詞。PSP 通常在症狀發作後的 3-6 6-8 年內致命 1。Swallow DMA 等人Mov Disord Clin Pract。2022 年 6 月 28 日；9 (5): 604-613。doi: 10.1002/mdc3.13489。2.Lyons S 等人J Neurol.2023；6 月 8 日 epub 提前出版。3.Stamelou M 等人Nat Rev Neurol. 2021；17 (10): 601-620。4.Viscidi E 等人Front Neurol。8 2021；12:571800。5.Golbe 和 Ohman-Strickland。大腦。 2007；130 (6): 1552-65。6.燕子和康塞爾。J Neurol。2023；270 (7): 3464-3474

PSP 底層的病理生理變化為 Target M MO OB BP P、S ST TX X6 6、、E EIIF F2 2A AK K3 3、、M MA AP PT T T T G ge en ne mu ut tiio on n n t t tau d dy ys sf fu un nc ct tiio on n T TR RIIM M1 11 1 G Ge en ne e m mu 但是 tat at tiio on ns s o ox xiid da at tiiv e iin njju ur ry y// T Ta au u C ce e e d de ec cr ree ea as se ed e e e e e e rg gy y and d d d R Re ep pa aiir r T tau a au A Ag gg gg gr 在 tiio on n • Ubiquitin-Proteasasir Home System • Autophagy-Lysosome 系統 M miit to oc ch hoon and dr riia all • 展開的蛋白質反應 D dy ys sf fun nc ct tiio on n n n n ne eu ur ro on na all C ce elll D de ea at n n n ne eu ur oin n ne eu ur ro oiin nf flla am mm at tiio on n n n ne eu ur ro oiin nf flla am mm at tiio on n n dy 我是 elliin at at tiio on n psp Park HK 等J Mov Discord。2021；14 (2): 103-113。9

1-9 AMX0035 可能通過多種機制影響 PSP Tau 病理學 M MO BP P,, S ST TX X6 6,, E EIIF F2 2A AK K3 3,, M MA AP T T G Ge en e m mu ut tiio on n n t t t tiio on n t t t tiio on n t t tiio on n T TR RIIM M1 11 1 G ge en e e m mu ut ta at tiio on n ns s o ox xiid da at tiiv ve e iin njju ur ry y// T ta a u ce e e e d de ec cr ree ea as se ed e e e e e e e e e e e e e e e e e e e e e e e e e a and d d d R Re ep pa aiir r r T tau a gg gr re eg gg ga ai n n • Ubiquitin-Proteasome System • Autophagy-Lysosome System M miit to oc ch ho on還有 dr riia all • 展開的蛋白質反應 D dy ys sf fun nc ct tiio on n n n n ne eu ur ro on na all C ce elll D de ea at n n n ne eu ur ro oiin at tiio on n n n n ne eu ur oin oiin nf flla am mm at tiio on n n de eu n n ne eu ur oiin nf flla am mm at tiio on n n d sm 我是 elliin na at tiio 我在 PSP 1 上開啟。Park HK 等人J Mov Discord。2021；14 (2): 103-113。2.Cohen J 等人海報發表於：第 28 屆 ALS/MND 國際研討會；2017 年 12 月 4 日至 10 日；馬薩諸塞州波士頓。3.周偉傑生物化學 2011；286 (17): 14941-14951。4.Rodrigues CM，Steer CJ。Expert Opin Investig Drugs。2001；10 (7): 1243-1253。5.Rodrigues CM 等人生物化學。2003；42 (10): 3070-3080。6.Ricobaraza A 等人神經心理藥理學。2009；34 (7): 1721-1732。7.Bondulich MK 等Brain。2016；139 (8): 2290-2306。10 8. van der Harg JM 等人Cell Death Dis. 2014；5 (8): e1393。9.Arnold SE 等人海報發表於：第 15 屆阿爾茨海默病臨牀試驗；2022 年 11 月 29 日至 12 月 2 日；加利福尼亞州舊金山。

臨牀前數據支持苯丁酸鈉 (PB) 用於潛在的 治療 PSP MOBP、STX6、EIF2AK3、MAPT 基因突變 Tau 功能障礙 PB 在 PSP 小鼠模型中有效，TRIM11 基因突變減少了 AD 小鼠模型 O O oxx xiiid d da a att tiiiv v e e iiiin n njju u ur rry/// Tau Clearing D de ec ree ea as se ed d e en ne er rg gy y 能量減少和修復 Tau 聚集 PB 減少了 tau 病理並改善了認知和運動功能 • 泛素-蛋白酶體系統 5,6 • 自噬-溶酶體系統線粒體 測量在相關小鼠模型 M miit to oc ch ho on nd dr riia all • 展開的蛋白質反應 DD D ys y yf s s su f fu u n n cc tiio iio o n n 神經元細胞死亡和神經變性 • 阿爾茨海默氏症 APP/PS1 小鼠模型： 減少了 tau 磷酸化 5 並改善了認知神經炎症髓鞘化 • tau35 PSP 小鼠模型（如圖所示）：減少了 tau 磷酸化和 6 改善認知和運動功能 PSP 6 6 Morris Water Maze Grip Strength 鈉 苯丁酸鹽可上調和招募伴侶蛋白，穩定蛋白質摺疊並降低 ER體外壓力和 1-4 展開的蛋白質反應 (UPR) 1.Zhou W. J Biol Chem. 2011；286 (17): 14941-14951。2.Wiley JC 等人PloS One。 2010；5:e9135。3.Mimori S 等人Biol Pharm Bull。2012；35:84-90。4.Cho JA 等人PloS One 2014；9:e110086。5.Ricobaraza A 等人神經心理藥理學。11 2009；34 (7): 1721-1732。6.Bondulich MK 等人Brain。2016；139 (8): 2290-2306。

臨牀前數據支持 Taurursodiol (TURSO) 用於潛在治療 PSP MOBP、STX6、EIF2AK3、MAPT 基因突變 tau 功能障礙 TURSO 降低了 TRIM11 基因突變細胞模型中的 p-tau 3 代謝應激氧化損傷/Tau 清除 T ta au u C 細胞 ea ar ar a e e 能量降低 a a an n nd d d d d r R ree ep p pa a aia iiir r r Tau 聚合 3 Taurursodiol (TURSO) 在體外減少了 tau 磷酸化 • 泛素-蛋白酶體系統 • 自噬-溶酶體系統線粒體 • 展開的蛋白質反應功能障礙神經元細胞 死亡和 3使用 TURSO 神經變性降低 p-tau 神經炎症 dysmyelination PSP Taurursodiol 穩定線粒體 • 2 脱氧葡萄糖 (2DG) 誘導的神經元細胞 3 模型中的代謝應激，通過減少細胞 3 死亡調節劑 Bax 的易位，改善線粒體 • TURSO (T) 減少 p-tau 水平的增加功能和能量產生，從而增加 p-tau 水平 膜 1,2 細胞凋亡閾值 12 1.Rodrigues CM，Steer CJ。 Expert Opin Investig Drugs。2001；10 (7): 1243-1253。2.Rodrigues CM 等人生物化學。2003；42 (10): 3070-3080。3. van der Harg JM 等人Cell Death Dis. 2014；5 (8): e1393。

許多臨牀前研究表明，AMX0035 組合同時靶向 多種途徑以預防或減緩細胞死亡 2 劑量矩陣研究：剖析 ALS 的小鼠模型 1 原發性皮質神經元損傷模型 I in n v viit tr ro o，A AM MX X0 00 35 5 co mb biin na at tiio on n n n d d de em mo on ns st tr ra at te ed d s sy yn er r g giis st tiic c i 在 n m mo 你用 see e m mo of f A AL LS S，A AM MX X0 00 03 35 5 co om mb biin na at tiio on n n d de em mo on ns st tr ro ot ec ct tiio on f f f c co of f f f c co of rttiic ca ne eu ur ro on ns s ag ga aiin ns st t p pe er ro ox xiid de e-m ed diia 在最後 d n ne eu ur ron na all s sy yn ne er rg giis st tiic cd de cr ree as se e e iin n n mo of fu un nc ct tiio on n d de ec cliin ne e e c ce elll d de ea at h •• A AM MX X0 00 03 35 5 co o mm mb biin na at tiio on n s siig gn niif fiic ca 不能 yd de ec cr ree ea at n n d d d ec ct tiio n n d d de ec cliin ea e eit the er r P P B o or r r T TU UR RS SO O a ad dm mini niis st tr ra tiio on n a allonne e e p pr re eve en net ed d a m mod de er ra at e e iin n a m mod 你用 se e e m mod de ell of f a all ls s p pe er rc ce en net ge e of f n ne eu 你在 h iin n v viit tr ro o o t the hiis s s b be en ne ef fiit t w 就像我們一樣 nly y se ee en n n w why en n n n n c co om mb biin ng g P P B a and d d d T TU RS O a and d d d n no ot t t t t t t t n nee ea ar rally y y 1 100 000 0% of f n ne eu ur ro on na all d de ea at h h w witth h iin and diiv viid du ua all P PB o or r T TU UR RS SO O t tr ree ea at tm me ent t iin n v viit tr ro o 1。Cohen J 等人AMX0035 治療肌萎縮性側索硬化症 (CENTAUR) 的 II 期、隨機、安慰劑對照試驗的臨牀試驗設計。海報發表於：第 28 屆 ALS/MND 國際研討會；2017 年 12 月 4 日至 10 日；馬薩諸塞州波士頓。2.Timmons J，13 等苯丁酸鈉和熊多西考牛磺酸組合對錶現為進行性運動神經元變性表型的轉基因小鼠的功效。海報於 2023 年 ENCALS 會議；2023 年 7 月 12 日至 14 日；西班牙巴塞羅那。

大量臨牀前研究表明，AMX0035 組合同時靶向 多種途徑以預防或減緩細胞死亡 2 劑量矩陣研究：剖析 ALS 的小鼠模型 1 原發性皮質神經元損傷模型 2 26 6 p pr riim ma ar ry p ph ha ar rm ma ar co dy yn na am miic c s st tu ud diie es of A AM MX X0 0 03 35 5 s su up pp pop or rt t e ef fe ef fe ec ct t iin n r re elle eva 不是 me ec ch 有 niis st tiic c p pat the way yes for r r r 3 3 ot tiiv ve e d diis se eaas se es s 3 3...D da at ta o on n f Fiille e i in n v viit tr ro o，A AM MX X0 00 03 35 5 c co o mb biin na at tiio on n n d de em mo n ne rg giis st tiic ci i in n n m mo 你用 se e m mo of f A AL LS S， A AM MX X0 00 03 35 5 co mb biin na at tiio on n n n d de em mo on n n n d d de em mo 在最後 d p pr ro ot ec ct tiio on n f f c co of f f c co of rt tiic ca aiin ns s ag ga aiin ns st p pee rox xiid de e-m ed diia 最後是 diia br} eu ur ro on na all s sy yn ne er rg giis st tiic c c d de ec cr re ea as se e iin nm mo ot or r f fu un nc ct tiio on n n d de ec ce cellill de ea at h h •• A AM MX X0 00 03 5 co om mb biin na at tiio on n s siig gn niif fiic 不能 y d de ec cr ree ea at se ea ed d d m mo tie iio on n d de ec clliin ne e e •• E Eiit the er r P PB o or r T TU UR RS O a 和 dm mini niis set tr at tiio on a pr re en en not en a m mod de er ra at e in a m mod de er ra at en a m mo de er ra 你用 see e m mod de en of a mod of a AL LS S p pe er rc ce en net tag ge e of f f n ne eu ur ro on na all c ce elll dde ea at th h iin n v viit tr ro o • T hiis s b be en ne ef fiit t t wh as as as as a no t t t wh as n n n e e e n n n e n n n n n t t tu ur rs so o a and d d d d d n ad d d d am a no t t a• A AM MX X0 0 03 35 5 co om mb biin na at tiio on n p pr ree ea en nee ea arlly y y 1 10 000 0% of f f n ne eu ur on ne eu on ne eu on na de ea 在 h wiit h iin 和 diiv viid du ua all P PB o or r T TU UR RS SO T tre ea at tm ea ea tm ea ea ea not t iin n viit tr ro o 1.Cohen J 等人AMX0035 治療肌萎縮性側索硬化症 (CENTAUR) 的 II 期、隨機、 安慰劑對照試驗的臨牀試驗設計。海報發表於：第 28 屆 ALS/MND 國際研討會；2017 年 12 月 4 日至 10 日；馬薩諸塞州波士頓。2.Timmons J，14 等苯丁酸鈉和 Ursodoxicoltaurine 組合對錶現為進行性運動神經元變性表型的轉基因小鼠的功效。海報在 2023 年 ENCALS 會議上發佈；2023 年 7 月 12 日至 14 日；西班牙巴塞羅那。

AMX0035 在阿爾茨海默氏病患者的隨機安慰劑 對照試驗中顯著降低了腦脊液 Tau 和 p-tau 第 24 周平均值 (SE) CSF p-tau181 與基線相比基線變化 40 安慰劑 AMX0035 安慰劑 AMX0035 20 0 8.8 -20 —0.27 (15.2) -10 (2.9) -40 -60 差異 -20 —14.6 — —7 73 3.. 7 7 p pg g/ /m mL L — —1 14 4.. 4 4 p pg g/ /m mL L (3.0) -80 —64.9 P P

在蛋白質組學分析中，AMX0035 顯示可以減少 Tau 蛋白 Tau 蛋白 288 在腦脊液和血漿中測量的 288 個蛋白質中，Tau 蛋白是 AMX0035 1 變化最大的蛋白質 1。文件 16 中的數據蛋白質組學分析是 PEGASUS 用於治療 阿爾茨海默氏病的 AMX0035 試驗中預先指定的探索性分析。

1,2 AMX0035 在 ALS 中減緩疾病進展並延長存活時間 3-5 ALS 和 PSP 分享幾個表型特徵和共同的疾病機制 3 表明對肌萎縮性側索硬化症有效的藥物可能對 PSP 有效 3 4,5 共同的疾病機制共同的表型特徵展開蛋白質反應吞嚥 困難線粒體功能障礙神經炎症言語障礙蛋白質錯誤摺疊和聚集認知受損 1.Paganoni S 等人N Engl J Med. 2020；383 (10): 919-930。2.RELYVRIO。處方信息。 Amylyx Pharmicals, Inc.；2022. 3.Wilson DM 3rd 等人手機。2023 年 2 月 16 日；186 (4): 693-714。4.Viscidi E 等人Front Neurol。2021；12:571800。5.Brown RH，Al-17 Chalabi A.N Engl J Med. 2017；377 (2): 162-172。

關鍵要點 • PSP 是一種與 tau 功能障礙、tau 聚集和廣泛的神經變性相關的滑稽療法。• 多種途徑，與 PSP 的 tau 病理有關。• AMX0035 旨在通過多種途徑緩解 PSP 中的 tau 病理學。• 臨牀前和 臨牀證據支持 AMX0035 可以減少 tau 病理學。18

ORION 3 期 PSP 試驗設計全球臨牀 開發負責人 Lahar Mehta 博士，Amylyx 19

殘疾惡化已完成的 PSP 臨牀研究在 Valided Endpoint Dam 等人 2021 年顯示出一致 和可衡量的進展。Höglinger 等人 2021。Boxer 等人 2014迄今為止進行的三項大型全球臨牀試驗顯示，Progressive Supranuclear Palsy 評級量表 (PSPRS) 每年持續進展約10個百分點，噪音相對較低 20 殘疾惡化殘疾惡化

ORION：在 PSP 中對 AMX0035 進行 3 期臨牀試驗主要目標： 評估 AMX0035 的關鍵資格標準與安慰劑對疾病進展率的影響，由 PSPRS 衡量 • 40-80 歲的成年人 • 根據 2017 年 MDS 標準 可能或可能的 PSP（Steele-Richardson-Olszewski 綜合症）1,2 AMX0035 • 存在 PSP 症狀

ORION 臨牀試驗終點疾病進展初級 1 • PSPRS 總分數（28 項）終點疾病進展運動方面次級計劃啟動試驗 1 • 修改了 10 項 PSPRS 日常生活終點 2023 年底 2 分• MDS-UPDRS 第二部分評分腦萎縮 生物標誌物其他 3 5 • 腦容量 (MRI) • 腦脊液和終點神經元損傷和神經元損傷的血漿生物標誌物負擔和生活質量炎症 4 • 參與者 QoL 並計劃在美國註冊地點、護理人員負擔 加拿大總體生存期、歐洲以及日本 1.PSPRS，漸進式核上麻痺評級量表 2。MDS-UPDRS，運動障礙協會統一帕金森氏病評級量表 3。核磁共振成像、磁共振成像 4.QoL，生活質量 22 5. 腦脊液、腦脊液

PSP 符合我們下一個潛在適應症的嚴格標準 AMX0035 Clear 未滿足的需求強有力的科學依據生物標誌物證據與 ALS 的鄰接關係和協同作用對疾病自然史的現有和深刻理解 KOL 和倡導團體的興趣和支持 23

問答環節 24