根據第424(B)(3)條提交的招股章程

登記檔案編號333-233828

認股權證購買普通股3，200，000股

(行使該等認股權證可發行的普通股達3，200，000股)

招股章程補編第1號

日期：2020年3月2日

(致2019年10月21日招股章程)

本説明書第1號，日期為2020年3月2日(“補編第1號”)，由Bionano基因組公司提交。(“公司”)修改和補充公司2019年10月21日的招股説明書(經不時修訂和補充的“招股章程”)所載的某些信息，作為證券交易委員會於2019年10月21日宣佈有效的公司表格S-1登記聲明的一部分。本補編第1號不完整，除與招股説明書有關外，不得交付或使用，包括其所有修正案和補編。經本補編第1號修訂的招股説明書涉及根據“協定”的條款(如下文所界定的)，提供認股權證，以購買至多3 200 000股我們的普通股(統稱為“認股權證”)(以及在行使這些認股權證時可不時發行的普通股股份)。

在2020年3月2日，我們與認股權證的某些持有人(“持有人”)達成了一項權證修正和協議(“協議”)，商定：(I)修改持有人持有的、可行使的認股權證，最多可行使320萬股普通股，以便在從我們向持有人交付本補編第1號時起至上午9時15分，將這些認股權證的行使價格降低到每股0.75美元(而不是無現金行使)。在交收日期後的營業日(“經修改的行使價格條款”)及(Ii)在經修訂的行使價格條款(“證券法”)所附的協議(“新認股權證”)所附形式的持有人獲豁免受1933年“證券法”(“證券法”) 登記規定規限的交易中，在該日期後的營業日(“經修改的行使價格條款”)的東部時間，我們將向該持有人發出一份新的認股權證(“新認股權證”)。根據“ 證券法”第4(A)(2)節，新認股權證最初可行使在經修改的行使價格期限內根據該授權書向持有人發行的相同數目的普通股股份，行使價格為每股1.06美元。新認股權證將於發行日六個月後的六個月內開始行使，為期五年。

因此，本補編第1號修訂和補充了招股説明書，以反映持有人在經修改的行使價格期限內持有的認股權證的行使價格根據“協定”的規定，從每股0.86美元的普通股改為每股0.75美元。在“協定”之後，如果根據“協定”修訂的所有認股權證在經修改的行使價格期限內以現金形式行使，則我們將得到240萬美元的總收入。

本補編第1號中的資料部分地修改和取代了招股説明書所載的資料。任何在招股章程內修改或取代的資料，不得視為構成招股章程的一部分，但如經本補編第1號所修改或取代，則屬例外。我們可不時按需要提出額外的修訂或補充，以進一步修訂或補充招股章程。在作出投資決定前，你應仔細閲讀整份招股説明書及任何修訂或補充資料。

該公司的普通股在納斯達克資本市場交易，代號為“BNGO”。2020年3月2日，該公司普通股的收盤價為每股1.25美元。

投資公司的證券涉及風險。在對公司證券進行投資之前，你應閲讀並仔細考慮招股説明書中的“風險因素”一節和公司最近的10-K表格年度報告中所描述的風險，並隨後提交關於表10-Q的季度報告。

證券交易委員會和國家證券監管機構尚未批准或不批准這些證券，也未確定招股説明書或與其有關的任何補充或修正案是否真實或完整。任何相反的陳述都是刑事犯罪。

本補編第1號的日期為2020年3月2日。