CDXS-20210630
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美国
美国证券交易委员会
华盛顿特区，20549
表格：10-Q
(标记一)
☒根据1934年《证券交易法》第13或15(D)节规定的季度报告
在截至本季度末的季度内2021年6月30日
或
☐根据1934年“证券交易法”第13或15(D)节提交的过渡报告
在从日本到日本的过渡期内，日本将从日本过渡到日本，而日本将从日本过渡到日本，中国将从中国过渡到中国，从中国过渡到中国，中国将从中国过渡到中国。
委托文件编号：001-34705
___________________________
Codexis，Inc.
(注册人的确切姓名载于其章程)
_____________________________________________
特拉华州 71-0872999
(注册成立或组织的州或其他司法管辖区) (国际税务局雇主识别号码)
佩诺斯科特大道200号, 红杉城, 加利福尼亚
 94063
(主要行政办公室地址) (邮政编码)

注册人电话号码，包括区号：(650) 421-8100

根据该法第12(B)条登记的证券：
每节课的标题交易注册的每个交易所的名称
符号
普通股，每股票面价值0.0001美元CDX纳斯达克全球精选市场
用复选标记表示注册人是否：(1)在过去12个月内(或注册人被要求提交此类报告的较短期限内)，(1)已提交了1934年《证券交易法》(Securities Exchange Act)第(13)或15(D)节要求提交的所有报告；(2)在过去90天内，注册人一直遵守此类提交要求。是  ☒*☐
用复选标记表示注册人是否已在过去12个月内(或注册人被要求提交此类文件的较短时间内)以电子方式提交了根据S-T法规(本章232.405节)第405条规定必须提交的每个交互数据文件。是  ☒*☐
用复选标记表示注册人是大型加速申报公司、加速申报公司、非加速申报公司、较小的报告公司或新兴成长型公司。请参阅《交易法》第12B-2条规则中对“大型加速申报公司”、“加速申报公司”、“较小申报公司”和“新兴成长型公司”的定义。
大型加速滤波器☒加速的文件管理器☐
非加速文件服务器☐规模较小的新闻报道公司☐
新兴成长型公司☐
如果是一家新兴的成长型公司，用复选标记表示注册人是否选择不使用过渡期来遵守根据交易所法案第13(A)节提供的任何新的或修订的财务会计准则。☐
用复选标记表示注册人是否是空壳公司(如《交易法》规则第312b-2条所定义)。☐*☒
截至2021年8月2日，有64,640,734注册人普通股，每股票面价值0.0001美元，已发行。
1




Codexis，Inc.
表格10-Q季度报告
截至2021年6月30日的季度


目录
 页
数
第一部分财务信息
第一项。
财务报表(未经审计)
简明综合资产负债表
3
简明合并操作报表
4
股东权益简明合并报表
5
现金流量表简明合并报表
7
简明合并财务报表附注
9
第二项。
管理层对财务状况和经营成果的探讨与分析
29
第三项。
关于市场风险的定量和定性披露
45
第四项。
管制和程序
46
第二部分：其他信息
第一项。
法律程序
47
项目1A。
风险因素
47
第二项。
未登记的股权证券销售和收益的使用
47
第三项。
高级证券违约
47
第四项。
煤矿安全信息披露
47
第五项。
其他信息
47
第6项。
陈列品
48
签名
49

2


第一部分财务信息
项目1.财务报表
Codexis，Inc.
简明综合资产负债表
(未经审计)
(单位为千，每股除外)
2021年6月30日2020年12月31日
资产
流动资产：
现金和现金等价物$129,506 $149,117 
流动受限现金585 638 
对非市场债务证券的投资1,289 1,000 
金融资产：
应收账款19,488 13,894 
合同资产4,528 4,526 
未开票应收账款12,417 10,942 
**金融总资产36,433 29,362 
免税额、免税额、免税额：津贴(74)(74)
*金融资产总额，净额36,359 29,288 
盘存1,078 964 
预付费用和其他流动资产3,578 3,416 
流动资产总额172,395 184,423 
受限现金1,519 1,062 
对非流通股证券的投资3,430 1,450 
使用权资产--经营租赁，净额20,124 21,382 
使用权资产--融资租赁，净额68 119 
财产和设备，净值11,232 9,675 
商誉3,241 3,241 
其他非流动资产301 294 
总资产$212,310 $221,646 
负债与股东权益
流动负债：
应付帐款$3,164 $2,970 
应计补偿6,859 7,288 
其他应计负债9,082 10,272 
租赁债务的当期部分--经营租赁2,672 2,627 
递延收入2,313 1,824 
流动负债总额24,090 24,981 
递延收入，扣除当期部分3,166 2,967 
长期租赁义务--经营租赁20,992 22,324 
其他长期负债1,289 1,271 
总负债49,537 51,543 
承付款和或有事项(附注10)
股东权益：
优先股，$0.0001每股面值；5,000授权股份，无已发行和未偿还
— — 
普通股，$0.0001每股面值；100,000授权股份；
64,623股票和64,283分别于2021年6月30日和2020年12月31日发行和发行的股票
6 6 
额外实收资本542,519 536,516 
累计赤字(379,752)(366,419)
股东权益总额162,773 170,103 
总负债和股东权益$212,310 $221,646 
见未经审计的简明合并财务报表附注。
3


Codexis，Inc.
简明合并操作报表
(未经审计)
(单位为千，每股除外)
 截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
 2021202020212020
收入：
产品收入$14,717 $4,504 $24,943 $9,604 
研发收入10,736 10,463 18,542 20,033 
总收入25,453 14,967 43,485 29,637 
成本和运营费用：
产品收入成本4,318 1,699 8,536 4,240 
研发12,826 10,853 24,397 21,820 
销售、一般和行政12,795 8,522 24,193 17,512 
总成本和运营费用29,939 21,074 57,126 43,572 
运营亏损(4,486)(6,107)(13,641)(13,935)
利息收入206 57 382 323 
其他收入(费用)，净额23 13 (63)(72)
所得税前亏损(4,257)(6,037)(13,322)(13,684)
所得税拨备8 307 11 312 
净损失$(4,265)$(6,344)$(13,333)$(13,996)
每股基本和稀释后净亏损$(0.07)$(0.11)$(0.21)$(0.24)
用于计算每股基本和稀释净亏损的加权平均普通股64,434 59,000 64,363 58,944 
请参阅随附的未经审计的简明合并财务报表
4


Codexis，Inc.
股东权益简明合并报表
(未经审计)
(单位：千)
普通股其他内容
实缴
资本		累计赤字股东权益总额
截至2021年6月30日的三个月股票金额
截至2021年4月1日的余额64,488 $6 $539,220 $(375,487)$163,739 
股票期权的行使95 — 455 — 455 
股票奖励的公布42 — — — — 
员工股票薪酬— — 2,779 — 2,779 
非员工股票薪酬— — 65 — 65 
与股权奖励的净股份结算相关的已支付税款(2)— — — — 
净损失— — — (4,265)(4,265)
截至2021年6月30日的余额64,623 $6 $542,519 $(379,752)$162,773 
普通股其他内容
实缴
资本		累计赤字股东权益总额
截至2020年6月30日的三个月股票金额
截至2020年4月1日的余额59,017 $6 $449,121 $(350,061)$99,066 
股票期权的行使27 — 158 — 158 
股票奖励的公布81 — — — — 
员工股票薪酬— — 1,935 — 1,935 
非员工股票薪酬— — 4 — 4 
与股权奖励的净股份结算相关的已支付税款— — (33)— (33)
净损失— — — (6,344)(6,344)
截至2020年6月30日的余额59,125 $6 $451,185 $(356,405)$94,786 
请参阅随附的未经审计的简明合并财务报表
5


Codexis，Inc.
股东权益简明合并报表
(未经审计)
(单位：千)
普通股其他内容
实缴
资本		累计赤字股东权益总额
截至2021年6月30日的6个月股票金额
截至2021年1月1日的余额64,283 6 536,516 (366,419)170,103 
股票期权的行使213 — 1,678 — 1,678 
股票奖励的公布181 — — — — 
员工股票薪酬— — 5,405 — 5,405 
非员工股票薪酬— — 126 — 126 
与股权奖励的净股份结算相关的已支付税款(54)— (1,206)— (1,206)
净损失— — — (13,333)(13,333)
截至6月30日的余额。2021年64,623 $6 $542,519 $(379,752)$162,773 


普通股其他内容
实缴
资本		累计赤字股东权益总额
截至2020年6月30日的6个月股票金额
截至2020年1月1日的余额58,877 $6 $447,920 $(342,409)$105,517 
股票期权的行使32 — 197 — 197 
股票奖励的公布300 — — — 
员工股票薪酬— — 4,104 — 4,104 
非员工股票薪酬— — 4 — 4 
与股权奖励的净股份结算相关的已支付税款(84)— (1,040)— (1,040)
净损失— — — (13,996)(13,996)
截至2020年6月30日的余额59,125 $6 $451,185 $(356,405)$94,786 

请参阅随附的未经审计的简明合并财务报表
6


Codexis，Inc.
现金流量表简明合并报表
(未经审计，单位为千)
截至6月30日的六个月，
 20212020
经营活动：
净损失$(13,333)$(13,996)
对净亏损与经营活动中使用的现金净额进行调整：
折旧1,375 900 
摊销费用-使用权资产-经营和融资租赁1,309 1,336 
基于股票的薪酬5,531 4,108 
从研发活动中赚取的股权证券(477)— 
其他非现金项目(318)— 
营业资产和负债变动情况：
金融资产，净额(7,521)(6,258)
盘存(113)(315)
预付费用和其他资产(170)(824)
应付帐款436 (19)
应计补偿和其他应计负债(404)1,839 
其他长期负债(1,314)(1,270)
递延收入264 3,001 
用于经营活动的现金净额(14,735)(11,498)
投资活动：
购置房产和设备(4,344)(1,490)
出售财产和设备所得收益29 — 
股权证券投资(630)(1,000)
用于投资活动的净现金(4,945)(2,490)
融资活动：
行使股票期权所得收益1,679 197 
租赁债务的支付--融资租赁— (60)
与股权奖励的净股份结算相关的已支付税款(1,206)(1,040)
融资活动提供(用于)的现金净额473 (903)
现金、现金等价物和限制性现金净减少(19,207)(14,891)
期初现金、现金等价物和限制性现金150,817 92,221 
期末现金、现金等价物和限制性现金$131,610 $77,330 
补充披露现金流信息：
支付的利息$3 $4 
已缴所得税$— $5 
补充性非现金投资和融资活动：
已发生但尚未支付的资本支出$338 $90 
从研发收入中获得的资产$1,350 $— 

7


下表提供了截至2021年6月30日和2020年6月30日未经审计的简明综合资产负债表中报告的现金、现金等价物和限制性现金与上述未经审计的简明综合现金流量表中显示的相同金额总额的对账：

 六月三十日，
 20212020
现金和现金等价物$129,506 $75,649 
受限现金、流动现金和非流动现金2,104 1,681 
现金总额、现金等价物和限制性现金$131,610 $77,330 
见未经审计简明综合财务报表附注
8


Codexis Inc.

简明合并财务报表附注
(未经审计)
注1。业务说明
在未经审计的简明合并财务报表的这些附注中，“公司”、“我们”、“我们”和“我们”是指Codexis公司及其合并基础上的子公司。
我们在越来越多的行业中发现、开发和销售为客户提供价值的酶和其他蛋白质。我们认为蛋白质是一个巨大的、在很大程度上尚未开发的创造价值的产品来源，我们正在利用我们自2002年成立以来一直在不断改进的成熟技术，将越来越多的新型酶商业化，无论是作为Codexis专利产品还是与我们的客户合作。
我们是利用计算技术推动生物进步的先驱。自2002年以来，我们在CodeEvolver的开发上投入了大量资金®蛋白质工程技术平台，是我们竞争优势的主要来源。我们的技术平台由基于人工智能的专有计算算法提供支持，这些算法可以快速挖掘我们庞大且不断增长的蛋白质变异库的结构和性能属性。这些计算输出使下一代蛋白质变体的工程预测变得越来越可靠，从而实现了具有时间和成本效益的目标性能增强。除了强大的计算能力，我们的CodeEvolver®蛋白质工程技术平台整合了额外的模块能力，包括机器人高通量筛选和基因组测序、有机化学和生物过程开发，所有这些都是协调一致的，以快速创新适合用途的新型产品。
这项技术的核心历史应用一直是开发商业上可行的生物催化制造工艺，以便更可持续地生产复杂化学品。首先，从概念上为目标产品设计最具成本效益和最实用的流程。然后，我们使用CodeEvolver开发优化的生物催化剂来实现设计的过程®站台。工程生物催化剂候选者，每个项目有数千人，然后在与工艺相关的操作条件下使用高通量方法进行快速筛选和验证。这种方法产生了一种优化的生物催化剂，使得在传统制造设备中运行相对简单的成本效益过程成为可能。这也使得我们能够高效地将我们的工艺技术转让给我们的制造合作伙伴。
我们的CodeEvolver的成功体现®商业制造过程中的蛋白质工程技术平台需要多个技术学科的专业知识很好地整合。除了直接集成到我们的CodeEvolver中的那些能力之外®除了分子生物学、酶学、微生物学、细胞工程、代谢工程、生物信息学、生物化学和高通量分析化学等蛋白质工程平台外，我们的工艺开发项目还涉及有机化学、化工工艺开发、化学工程、生物工艺开发和发酵工程方面的综合专业知识。我们综合的、多学科的产品和流程开发方法是公司成功的关键因素。
我们最初将CodeEvolver商业化®小分子药物制造中的蛋白质工程技术平台和产品，这仍然是一个主要的业务重点。我们的客户，包括许多大型全球制药公司，在他们的工艺开发和制造中使用我们的技术、产品和服务。此外，我们还授权使用我们专有的CodeEvolver®为全球制药公司提供蛋白质工程技术平台，使它们能够在内部使用这项技术，为自己的业务设计酶。最近，在2019年5月，我们签订了平台技术转让和许可协议(“Novartis CodeEvolver® 协议“)与诺华公司达成协议。诺华公司的CodeEvolver®协议(我们与大型制药公司的第三份此类协议)允许诺华公司使用我们专有的CodeEvolver®蛋白质工程平台技术在人类保健领域的应用。
作为我们将技术扩展到制药以外的战略的证据，我们还利用该技术开发了生物催化剂和酶产品，用于更广泛的工业市场，包括几个大型垂直市场，如食品、饲料、消费者护理和精细化学品。此外，我们正在利用我们的技术为各种与生命科学相关的应用开发酶，例如用于体外分子诊断和基因组研究的下一代测序(“NGS”)和聚合酶链式反应(“PCR/qPCR”)。2019年12月，我们签订了一项许可协议，向罗氏测序解决方案公司提供我们针对这一目标市场的第一种酶：该公司的EvoT4™DNA连接酶。2020年6月，我们与Alphazyme LLC签订了一项联合营销和酶供应合作协议，生产和联合营销用于生命科学应用的酶，最初包括高保真DNA聚合酶、T7RNA聚合酶和逆转录酶。
9


我们一直在使用CodeEvolver®蛋白质工程技术平台与客户合作开发早期的新型生物治疗候选产品，并为我们自己的Codexis专利候选药物提供技术支持。我们的第一个项目是针对人类苯丙酮尿症(“PKU”)的潜在治疗。PKU是一种遗传性代谢紊乱，将必需氨基酸苯丙氨酸转化为酪氨酸的酶缺乏。2017年10月，我们与法国兴业银行(Societédes Produits NestléS.A.，前身为雀巢有限公司(NestléHealth Science))签订了一项全球开发、选择和许可协议(“雀巢许可协议”)，以推动我们的酶生物治疗产品CDX-6114的发展，CDX-6114是我们潜在治疗PKU的候选酶生物治疗产品。2019年2月，雀巢健康科学行使选择权，获得CDX-6114的独家开发和商业化许可。同样在2017年10月，我们与雀巢健康科学公司(NestléSCA)签订了一项战略合作协议，根据该协议，我们和雀巢健康科学公司正在合作利用CodeEvolver®为雀巢健康科学已有的消费者护理和医疗营养业务领域开发其他新型酶的平台技术。2020年1月，我们与雀巢健康科学签订了一项开发协议，将雀巢SCA中发现的一种新的主要候选药物CDX-7108推向临床前开发和早期临床研究，作为一种潜在的胃肠道疾病治疗方法。与此同时，雀巢SCA延长至2021年12月，以支持发现治疗其他疾病的候选药物。于2020年3月，吾等与武田药业有限公司(“武田”)的全资附属公司夏尔人类基因治疗有限公司(Shire Human Genetic Treaties，Inc.)订立战略合作及许可协议(“武田协议”)，以研究及开发针对某些疾病适应症的新型基因疗法，包括治疗溶酶体储存障碍及血因子缺乏症。
2020年6月，我们与分子组装公司(MAI)签订了主协作和研究协议(MAI协议)，根据该协议，我们正在利用我们的CodeEvolver®平台技术，以改进DNA聚合酶，这些酶对酶促DNA合成至关重要。在签订MAI协议的同时，我们与MAI签订了一份股票购买协议，根据该协议我们购买了1,587,050麦氏A系列优先股作价$1.0在这笔交易中，我们的总裁兼首席执行官约翰·尼科尔斯(John Nicols)加入了Mai的董事会。2021年4月，我们额外购买了一台1,000,000麦氏A系列优先股作价$0.6百万美元。
有关更多信息，请参阅附注12“部门、地理和其他收入信息”。
以下是我们业务细分的简要说明：
性能酶
我们最初将CodeEvolver商业化®蛋白质工程技术平台和产品在小分子药物制造中发挥着重要作用，到目前为止，这仍然是我们服务的最大市场。我们的客户，包括许多大型全球制药公司，在他们的制造过程和过程开发中使用我们的技术、产品和服务。我们还利用这项技术开发了定制的酶，供其他工业市场使用。这些市场由几个大型工业垂直市场组成，包括食品、饲料、消费者护理和精细化学品。我们还将我们的技术用于生命科学市场，为客户开发使用NGS和PCR/qPCR的酶，用于体外分子诊断和分子生物学研究应用，以及DNA/RNA合成和健康监测应用。
新型生物疗法
我们还瞄准了制药业的新机会，以发现、改进和/或开发生物治疗药物候选药物。我们相信我们的CodeEvolver®蛋白质工程平台技术可以用来发现新的生物治疗药物候选药物，这些药物将针对需要改进治疗干预的人类疾病。同样，我们相信，我们可以利用我们的平台技术来改善客户已有的生物治疗候选药物的具体特性，如活性、稳定性或免疫原性。
我们的第一个主导项目是针对人类PKU的潜在治疗。PKU是一种遗传性代谢紊乱，将必需氨基酸苯丙氨酸转化为酪氨酸的酶缺乏。2017年10月，我们宣布与雀巢健康科学公司达成一项全球开发、选择和许可协议，以推动我们自己的新型口服给药酶疗法候选药物CDX-6114的发展，CDX-6114可用于潜在的PKU治疗。2019年2月，雀巢健康科学行使其选择权，获得了CDX-6114在全球范围内的独家、特许权使用费、可再许可的许可，用于管理PKU的CDX-6114的全球开发和商业化。作为期权活动的结果，我们赢得了一个里程碑，并获得了$3.02019年第一季度收入为100万美元。在行使选择权后，雀巢健康科学公司承担了CDX-6114未来临床开发和商业化的所有责任。
2017年10月，我们签署了雀巢SCA，根据该协议，我们和雀巢健康科学正在合作利用CodeEvolver®为雀巢健康科学已有的消费者护理和医疗营养业务领域开发其他新型酶的平台技术。雀巢SCA延长至2021年12月。2020年1月，
10


我们和雀巢健康科学公司签订了一项开发协议，根据该协议，我们和雀巢健康科学公司正在合作，针对通过雀巢SCA发现的一种胃肠道疾病CDX-7108进行临床前和早期临床研究。在2021年期间，我们与雀巢健康科学一起，继续推进CDX-7108，以启动一期临床试验，我们预计该试验将于2021年第四季度开始。此外，各方正在根据雀巢SCA推进三个针对不同胃肠道疾病的项目。
2020年3月，我们签订了武田协议，根据该协议，我们正在根据针对Fabry病、Pompe病和一种未披露的血因子缺乏症的各自项目计划，合作研究和开发用于某些疾病适应症的基因治疗产品的蛋白质序列。2020年3月，我们收到了一笔一次性、不可退还的现金付款$8.5百万美元。在这些计划中，Fabry病计划是最先进的，已经向武田提供了包括CDX-6311在内的多个序列。2021年5月，武田选择行使他们的选择权，将合作扩大到一种未披露的罕见遗传疾病的第四个项目。
新冠肺炎相关商业动态
当前的新冠肺炎大流行给我们带来了风险和不确定性。新冠肺炎疫情给世界各地的公共卫生和经济带来了巨大的挑战，正在影响我们的员工、社区和业务运营，以及美国经济和世界各地的其他经济体。新冠肺炎疫情将在多大程度上直接或间接影响我们的业务、运营结果和财务状况，将取决于未来的事态发展，这些事态发展具有高度不确定性，可能无法准确预测，包括疫情的持续时间和严重程度以及对客户影响的程度和严重程度，可能出现的有关新冠肺炎的新信息，为遏制疫情或应对其影响而采取的行动，以及对当地、地区、国家和国际市场的经济影响。
到目前为止，我们和我们的合作伙伴能够继续向全球客户供应我们的酶。然而，我们依赖于我们的制造和物流合作伙伴，因此，我们合作伙伴和客户的运营中断可能会影响我们向客户供应酶的能力。此外，我们提供未来研发(R&D)服务的能力将继续受到政府订单和与我们合作的客户运营中断的影响。我们认为，这些中断对截至2021年6月30日的三个月和六个月的收入影响微乎其微。大流行可能对我们的业务运作和经营业绩造成多大程度的影响，仍将高度取决于未来的事态发展，这些事态发展是不确定的，也不能有把握地预测。
在美国，新冠肺炎的影响，包括大流行期间管理企业运营的政府命令(“命令”)，导致我们位于加利福尼亚州红杉市的工厂暂时关闭，并扰乱了我们的研发业务。根据这些命令，从2020年3月中旬到2020年4月底，几个项目的研发作业暂时停止。2020年5月，我们启动了有限的研发业务，并加大了运营力度，目前我们正在利用大部分正常的研发能力，同时遵循县、州和联邦新冠肺炎保护员工的指导方针。此外，我们于2020年5月恢复了红杉城试点工厂的生产。
我们未来的经营业绩和流动性可能会受到超出正常付款条件的未偿还应收账款的延迟支付、供应链中断和不确定的需求，以及我们可能采取的任何解决客户面临的财务和运营挑战的计划或计划的影响。新冠肺炎对我们未来的财务状况、流动性或运营结果的近期和长期影响仍不确定。尽管为控制新冠肺炎传播而颁布的一些命令已经缩减，疫苗推出也有所扩大，但由于出现新的更具传染性的变种或针对这些毒株的疫苗无效而导致的新冠肺炎传播激增，可能会导致某些订单重新执行，这可能会对我们的业务产生不利影响。有关新冠肺炎大流行构成的各种风险的更多信息，请阅读项目1A。风险因素包含在我们于2021年3月1日提交的截至2020年12月31日的财政年度Form 10-K年度报告中。
注2。主要会计政策的列报和汇总依据
列报依据和合并原则
随附的未经审核简明综合财务报表乃根据美国公认会计原则(“GAAP”)及美国证券交易委员会(“SEC”)有关中期财务资料的适用规则及规定编制，但并不包括GAAP就完整财务报表所需的所有资料及附注。这些未经审计的中期简明综合财务报表应与我们截至2020年12月31日的年度报告Form 10-K中包含的已审计综合财务报表及其附注一并阅读。的压缩综合资产负债表
11

2020年12月31日衍生自该日经审计的综合财务报表，但不包括GAAP要求的完整财务报表所需的所有披露，包括附注。编制截至2021年及2020年6月30日止三个月及六个月的未经审核简明综合财务报表所使用的重要会计政策，与本公司2020年年报10-K表格中经审核综合财务报表附注2所述的政策一致，并在有需要时更新如下。自2020年12月31日以来，我们的重大会计政策或关键会计估计没有重大变化。
为符合2021年的列报，未经审计的现金流量简明报表中对上一年度的某些金额进行了重新分类，但这些重新分类对报告的经营业绩没有影响。
未经审核简明综合财务报表乃按与经审核综合财务报表相同的基准编制，管理层认为，该等报表反映所有正常经常性调整，以公平反映我们截至2021年6月30日的财务状况、截至2021年6月30日及2020年6月30日的三个月及六个月的经营业绩、截至2021年及2020年6月30日的三个月及六个月的股东权益变动，以及截至2021年6月30日及2020年6月30日的六个月的现金流量。中期业绩不一定代表未来任何中期或全年的业绩。
未经审计的简明合并财务报表包括Codexis公司及其全资子公司的账目。所有公司间余额和交易均已在合并中冲销。
预算的使用
根据公认会计原则编制未经审计的简明综合财务报表要求我们作出可能影响资产、负债、权益、收入和费用的报告金额以及或有资产和负债的相关披露的估计、判断和假设。我们定期评估这些估计，这些估计主要影响收入确认、库存、业务收购产生的商誉、应计负债、股票奖励以及与递延税项资产相关的估值免税额。实际结果可能与这些估计不同，这种差异可能会对合并财务报表产生重大影响。新冠肺炎疫情对我们的业务、运营结果和财务状况(包括销售、费用、储备和津贴、制造、研发成本和员工相关金额)产生直接或间接影响的全面程度将取决于高度不确定的未来发展，而且可能无法准确预测，包括可能出现的有关新冠肺炎的新信息和采取的遏制或治疗新冠肺炎的行动，以及对当地、地区、国家和国际客户、市场和经济体的经济影响。
财务报表排除
截至2021年6月30日及2020年6月30日止三个月及六个月的未经审核简明综合经营报表的净亏损，与同期未经审核的简明综合全面亏损报表并无不同。因此，未经审核简明综合财务报表不包括截至2021年6月30日及2020年6月30日止三个月及六个月的未经审核简明综合全面亏损报表。
会计声明
最近采用的会计声明
2019年12月，财务会计准则委员会(FASB)发布了ASU第2019-12号，所得税(话题740)：简化所得税的核算其目的是简化与所得税会计有关的各个方面。我们于2021年1月1日在修改后的追溯基础上采用了该标准。采用这一准则对我们未经审计的简明合并财务报表没有影响。
2020年10月，FASB发布了ASU第2020-10号，编码化的改进ASU 2020-10对FASB会计准则编纂中的各种主题进行了修订，该修订适用于受影响会计准则范围内的所有报告实体。我们于2021年1月1日追溯采用了该标准。采用这一准则对我们未经审计的简明合并财务报表没有影响。
最近发布的尚未采用的会计公告
自指定生效日期起，财务会计准则委员会或其他准则制定机构会不时发布新的会计公告。除非另有讨论，吾等相信最近颁布的尚未生效的准则在采纳后不会对本公司未经审核的简明综合财务报表产生重大影响。
12

2021年5月，FASB发布了ASU No.2021-04，每股收益(主题260)，债务修改和清偿(分主题470-50)，补偿-股票补偿(主题718)，以及实体自身股权的衍生品和对冲合同(分主题815-40)，发行人对独立股权的某些修改或交换的会计-分类书面看涨期权，新兴问题特别工作组的共识。该标准建立了一个基于原则的框架，根据标的交易的经济实质，对独立股权分类书面看涨期权的修改进行会计处理。该标准还要求递增披露财务报表。该标准影响按照主题260“每股收益”中的指导报告每股收益的实体。该标准适用于2021年12月15日之后开始的财年，包括这些财年内的过渡期，如果允许从包括该过渡期的财年开始时应用该标准，则允许提前采用该标准。本标准可用于在生效日期或之后发生的修改或交换。我们将评估股权分类书面赎回期权的修改，以确定该标准在发生时的适用性；然而，我们认为采用ASU 2021-04将不会对我们的未经审计的简明综合财务报表和相关披露产生影响。
2020年8月，FASB发布了ASU第2020-06号债务-带有转换和其他期权的债务(分主题470-20)和衍生工具和套期保值-实体自有股权合同(分主题815-40)2020年8月6日第2020-06号实体自有股权可转换工具和合同会计，以降低可转换债务工具和可转换优先股的复杂性和简化会计，以及实体自有股权合同的衍生品范围例外。此外，计算稀释后每股收益的指引也得到了简化，内部更加一致。该标准在2021年12月15日之后的财年有效，包括这些财年内的过渡期，允许在2020年12月15日开始的财年提前采用。本标准可以在修改后的追溯或完全追溯的过渡方法上采用，并且在采用时，实体可以不可撤销地根据子主题825-10选择公允价值选项，金融工具-总体而言，对于任何可转换证券的金融工具。我们相信，采用ASU 2020-06不会对我们未经审计的简明综合财务报表和相关披露产生影响。
2020年3月，FASB发布了ASU第2020-04号，参考汇率改革(主题848)：促进参考汇率改革对财务报告的影响。该标准为将GAAP应用于合约、套期保值关系和其他交易提供了可选的权宜之计和例外，在这些交易中，参考LIBOR或另一个参考利率预计将因参考利率改革而停止。该标准对所有实体都有效，不迟于2022年12月1日通过，并允许提前采用。该标准可以在预期的基础上采用。我们将评估由于参考汇率改革而发生的交易或合同修改，并决定是否为合同修改选择可选的权宜之计；然而，我们相信采用ASU 2020-04将不会对我们未经审计的简明综合财务报表和相关披露产生影响。
在截至2021年6月30日的三个月和六个月内，与本文描述的最近会计声明相比，没有其他最近的会计声明或会计声明的变化对我们具有重大意义或潜在意义。
13

注3。收入确认
收入的分类
下表提供了有关从与客户签订的合同中获得的按产品和服务性质以及地理区域分类的收入的信息，并包括分类收入与可报告部分的对账。跟踪的地理区域包括美洲(美国、加拿大和拉丁美洲)、EMEA(欧洲、中东和非洲)以及亚太地区(澳大利亚、新西兰、东南亚和中国)。
段信息如下(以千为单位)：
截至2021年6月30日的三个月截至2020年6月30日的三个月
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计
主要产品和服务：
*产品收入*$14,717 $— $14,717 $4,504 $— $4,504 
研发收入6,868 3,868 10,736 3,002 7,461 10,463 
总收入$21,585 $3,868 $25,453 $7,506 $7,461 $14,967 
主要地理市场：
美洲
3,703 2,141 $5,844 $1,173 $5,733 $6,906 
欧洲、中东和非洲地区
4,442 1,727 6,169 1,586 1,728 3,314 
APAC
13,440 — 13,440 4,747 — 4,747 
总收入$21,585 $3,868 $25,453 $7,506 $7,461 $14,967 
截至2021年6月30日的6个月截至2020年6月30日的6个月
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计
主要产品和服务：
*产品收入*$24,943 $— $24,943 $9,604 $— $9,604 
研发收入10,872 7,670 18,542 8,775 11,258 20,033 
总收入$35,815 $7,670 $43,485 $18,379 $11,258 $29,637 
主要地理市场：
美洲
$6,574 $4,199 $10,773 $4,171 $7,960 $12,131 
欧洲、中东和非洲地区
8,979 3,471 12,450 5,987 3,298 9,285 
APAC
20,262 — 20,262 8,221 — 8,221 
总收入$35,815 $7,670 $43,485 $18,379 $11,258 $29,637 
合同余额
下表显示了合同资产、未开单应收款、合同成本和合同负债的余额(以千为单位)：
2021年6月30日2020年12月31日
合同资产$4,528 $4,526 
未开票应收账款$12,417 $10,942 
合同费用$86 $90 
合同负债：递延收入$5,479 $4,791 

我们有不是截至2021年和2020年6月30日的三个月和六个月与金融资产相关的资产减值费用。
14

截至2021年6月30日和2020年12月31日，合同资产保持不变。未开票应收账款的增加主要是由于开票的时间安排。递延收入增加的主要原因是收到的现金预付款超过确认的收入。
我们确认了以下收入(以千计)：
截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
当期确认的收入为：2021202020212020
期初合同负债中包含的金额：
*履约义务已履行$1,239 $4,272 $1,391 $57 
期间的变化：
分配给前期履行义务的估计交易价格变动4,306 1,357 4,336 637 
期间新活动履行的履约义务--合同收入19,908 9,338 37,758 28,943 
总收入$25,453 $14,967 $43,485 $29,637 
履行义务
下表包括预计未来确认的与报告期末未履行或部分未履行的履约义务有关的收入估计数。估计收入不包括原始期限为一年或更短的合同，可归因于特许权使用费的可变对价金额，或截至2021年6月30日未行使的合同续签。
下表中的余额部分基于对截至2021年6月30日根据各自合同行使实质性权利的客户未来订单的估计(以千为单位)：
2021年剩余时间202220232024年及其后总计
产品收入$— $67 $67 $1,843 $1,977 
研发收入1,568 1,388 546 — 3,502 
总收入$1,568 $1,455 $613 $1,843 $5,479 

注4.N每S的ET损失野兔
每股基本净亏损的计算方法是将净亏损除以已发行普通股的加权平均数、可被没收的限制性较少股票奖励(“RSA”)。每股摊薄净亏损的计算方法是将净亏损除以已发行普通股的加权平均股数，减去可被没收的RSA，再加上本应发行的所有额外普通股，假设已发行稀释性潜在普通股用于其他稀释性证券。
反稀释证券
在净亏损期间，在库存股方法应用之前的加权平均流通股数量在计算每股普通股稀释净亏损时不包括潜在的稀释证券，因为计入此类股票将具有反稀释效果。
15

在计算每股摊薄净亏损时不考虑以下股票，因为它们的影响是反摊薄的(以千计)：
 截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
 2021202020212020
根据股权激励计划可发行的股票5,3665,2895,3665,289

注5。对非流通证券的投资
非流通债务证券
我们将被计入可供出售的非市场债务证券归类在公允价值层次的第三级，因为我们基于使用最新可观察到的交易价格和其他重要的不可观察到的输入(包括我们所持证券的波动性、权利和义务)的定性分析来估计公允价值。
我们使用特定的识别方法来确定非流通债务证券的出售或清偿的收益或损失。代表股票结算赎回特征的分叉嵌入衍生品的未实现收益和亏损在未经审计的简明综合经营报表中记为其他费用净额。非流通债务证券的未实现损益在实现之前记为其他全面损失的组成部分。已实现的收益或损失记为其他收入(费用)的一个组成部分，净额。
在截至2021年6月30日的三个月和六个月里，我们确认了0.2300万美元和300万美元0.3来自债务摊销的利息收入、贴现利息和我们投资于非市场债务证券的利息收入分别为80万美元和800万美元57.510000美元的其他收入和$10.510000美元的其他费用在其他收入(费用)中，分别按嵌入的分叉衍生工具的公允价值变化计算净额。我们认识到不是截至2021年6月30日的三个月和六个月内的未实现或已实现损益。我们认识到不是截至2020年6月30日的三个月和六个月的利息收入、其他费用以及未实现或已实现的损益。
下表按合同到期日列出了非上市债务证券的调整成本、账面价值和公允价值的余额(以千为单位)：
 2021年6月30日
调整后的成本和账面价值公允价值
1年或更短时间内到期的非流通债务证券$1,289 $1,289 
2020年12月31日
调整后的成本和账面价值公允价值
1年或更短时间内到期的非流通债务证券$1,000 $1,000 
非流通股证券
非流通股证券是对非上市公司的投资，其市值不能轻易确定。我们使用一种计量替代方案来计量非流通股权证券的投资，该计量备选方案采用成本法减去减值(如果有的话)，加上或减去非经常性基础上可观察到的价格变化所产生的变化来计量非流通股权证券的投资，但没有容易确定的公允价值。因减值而重新计量的非流通股证券的公允价值归入第三级。我们对期内重新计量的非流通股证券的账面价值进行调整，并将由此产生的损益确认为其他收入(费用)、净额的组成部分。我们认识到不是截至2021年6月30日和2020年6月30日的三个月和六个月内的未实现或已实现损益。
下表显示了非流通股权证券的账面价值余额(单位：千)：
 2021年6月30日2020年12月31日
非流通股证券$3,430 $1,450 

16

注6。公允价值计量
下表列出了在公允价值层次结构内按公允价值经常性计量的金融工具(以千计)：
 2021年6月30日
 1级2级3级总计
货币市场基金$111,083 $— $— $111,083 
非市场化债务证券— — 1,289 1,289 
*总计$111,083 $— $1,289 $112,372 
 2020年12月31日
 1级2级3级总计
货币市场基金$127,567 $— $— $127,567 
非市场化债务证券— — 1,000 1,000 
*总计$127,567 $— $1,000 $128,567 
由于减值而重新计量的非流通证券的公允价值将被归类为3级。在截至2021年6月30日和2020年6月30日的三个月和六个月里，我们这样做了不是I don‘我不承认任何重大的信贷损失不是R非流通证券的暂时性减值损失。我们非流通证券的账面价值接近公允价值。
注7。资产负债表明细
现金等价物
截至2021年6月30日和2020年12月31日的现金等价物包括以下内容(以千为单位)：
 2021年6月30日2020年12月31日
 调整后的成本估计公允价值调整后的成本估计公允价值
货币市场基金(1)
$111,083 $111,083 $127,567 $127,567 
(1)在我们的综合资产负债表中，货币市场基金分为现金和现金等价物。平均合同到期日(以天为单位)不适用。
截至2021年6月30日，总现金和现金等价物余额为$129.5百万美元由#美元的货币市场基金组成。111.1百万美元和现金18.4百万美元，由主要金融机构持有。截至2020年12月31日，总现金和现金等价物余额为$149.1百万美元由#美元的货币市场基金组成。127.6百万美元和现金21.51000万美元与主要金融机构举行。
盘存
库存包括以下内容(以千计)：
2021年6月30日2020年12月31日
原料$49 $77 
在制品98 82 
成品931 805 
*库存减少。$1,078 $964 
库存包括#美元的储备。1.5截至2021年6月30日和2020年12月31日。
财产和设备，净值
财产和设备，净值如下(以千计)：
17

2021年6月30日2020年12月31日
实验室设备$28,623 $25,468 
租赁权的改进10,785 10,785 
计算机设备和软件3,283 3,192 
办公设备和家具1,246 1,246 
在建工程正在进行中1,736 2,357 
财产和设备45,673 43,048 
会计准则：累计折旧和摊销(34,441)(33,373)
**包括财产和设备，净值$11,232 $9,675 
未经审计的简明综合经营报表中包括的折旧费用如下(以千计)：
截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
2021202020212020
折旧费用$716 $462 $1,375 $900 
商誉
商誉的账面价值为$。3.2截至2021年6月30日和2020年12月31日。
其他应计负债
其他应计负债包括以下(以千计)：
2021年6月30日2020年12月31日
应计购货$5,107 $7,170 
应计专业服务费和外部服务费3,899 2,589 
其他76 513 
*总计$9,082 $10,272 
注8。基于股票的薪酬
股权激励计划
2019年，我们的董事会(以下简称董事会)和股东通过了2019年激励奖励计划(《2019年计划》)。2019年计划完全取代了我们于2010年3月生效的2010年股权激励计划(“2010计划”)，2010计划不会再授予其他奖励，但2010计划的条款和条件将继续管辖其下的任何未完成奖励。
2019年计划规定向本公司或任何母公司或子公司的合资格员工和顾问以及董事会成员授予股票期权，包括激励性股票期权和非限定股票期权、股票增值权、限制性股票奖励(RSA)、限制性股票单位(RSU)、或有限制性股票单位(PSU)、基于业绩的期权(PBO)、其他股票或现金奖励和股息等价物，这些股票期权包括激励性股票期权和非限制性股票期权、股票增值权、限制性股票奖励(RSA)、限制性股票单位(RSU)、或有业绩限制性股票单位(PSU)、业绩基础期权(PBO)和其他基于股票或现金的奖励和股息等价物。
根据2019年计划，我们的普通股可供发行的股票数量等于(I)7,897,144股份；及(Ii)根据2010年计划授予奖励的任何股份，但截至2019年4月22日仍未发行，此后终止、到期、失效或被没收；但条件是不超过14,000,000股票可以在行使激励性股票期权(“ISO”)时发行。2019年6月，8.1根据2019年计划授权发行的100万股股票是根据修订后的1933年证券法(“证券法”)登记的。
2010年计划规定向我们的员工、非员工董事和顾问授予激励性股票期权、非法定股票期权、RSU、RSA、PSU、PBO、股票增值权和股票购买权。
18

股票期权
激励性股票期权的期权行权价必须至少为100授予日我们普通股公允价值的%，非法定股票期权的期权行权价至少为85我们的普通股在授予日的公允价值的百分比，由董事会决定。如果在授予时，受权人直接或通过归属拥有的股票超过10%的全部已发行股本的总投票权，这些期权的行权价必须至少为110标的普通股公允价值的%。授予员工的股票期权通常最长期限为十年穿上背心四年了自授予之日起，其中25在一年结束时授予%，并且75在剩下的三年内按月授予%。我们可能会不时授予具有不同归属条款的期权。除非雇员因伤残或死亡而终止服务，否则在服务终止后，任何未行使的既得选择权将被没收。三个月或期权到期之日，以较早者为准。
限制性股票单位(“RSU”)
我们还授予员工RSU，通常授予三年句号为33在归属开始日期的每一年周年日或超过一年后，受RSU归属的股份的百分比四年句号为25在归属开始日期的每一年周年日，受RSU归属的股份的百分比，在每种情况下取决于该雇员在该归属日期的继续服务。如果在授予限制解除之前终止雇佣，RSU通常会被没收。我们可能会不时以不同的归属条款授予RSU。
业绩条件限制性股票单位(“PSU”)和基于业绩的期权(“PBO”)
董事会的薪酬委员会仅就非执行雇员批准，并授权我们的首席执行官批准发放PSU。董事会的薪酬委员会还批准了向我们的高管发放PBO和PSU。PSU和PBO的授予基于在指定时间内成功实现某些公司运营里程碑，以及在适用的归属日期之前继续受雇。当这些类型的奖励的绩效目标被认为有可能实现时，基于股票的薪酬费用开始确认。一旦确定了有资格归属的股份数量，这些股份就归属于二等额分期付款50%按业绩授予，其余部分50在每一种情况下，在成就一周年时的归属百分比，以接受者在适用归属日期之前的持续服务为准。如果业绩目标达到门槛水平，有资格就PSU和PBO归属的股份数量将等于所授予的PSU数量的一半，以及所授予PBO相关股份数量的四分之一。如果业绩目标达到目标水平，有资格就PSU和PBO归属的股份数量将等于已授予的PSU数量和已授予PBO相关股份的一半。如果业绩目标在较高级别实现，则有资格就PSU授予的股份数量将等于授予的PSU数量的两倍，并等于授予的PBO数量。在PSU和PBO的门槛和目标水平之间或PSU的目标水平和上级水平之间实现业绩目标时，可发行的股票数量将使用线性插值确定。低于门槛的成就将导致不是有资格就PSU和PBO归属的股份。
于2021年第一季度，我们授予PSU(“2021年PSU”)和PBO(“2021年PBO”)，每个PSU(“2021年PSU”)和PBO(“2021年PBO”)根据各种加权业绩目标的实现情况开始归属，包括公司收入、绩效酵素部门毛利率、重大新生物疗法宣传活动、战略绩效酶和生物疗法交付成果、安全性以及技术和战略计划开发。截至2021年6月30日，我们估计2021个PSU和2021个PBO的性能目标将在136%和68分别为目标额的%，并据此确认费用。
于2020年，我们授予PSU(“2020 PSU”)及PBO(“2020 PBO”)，其中每一项均根据各项加权业绩目标的实现情况开始归属，包括公司收入、绩效酵素部门毛利率、重大新生物疗法宣传活动、战略绩效酶和生物疗法交付成果以及战略计划制定。在2021年第一季度，我们确定2020年PSU和2020 PBO的绩效目标已在88目标水平的%，并相应地确认费用。因此，502020年PSU和PBO相关股份的百分比在2021年第一季度归属，502020年PSU和PBO相关股份的%将在2022年第一季度授予，这取决于接受者在每个归属日期的持续服务。
于2019年，我们授予PSU(“2019年PSU”)和PBO(“2019年PBO”)，每个PSU均根据各种加权业绩目标的实现情况开始归属，包括持续的收入和业绩酶增长、生物疗法的战略推进、现金余额和战略计划制定。在2020年第一季度，我们确定2019年PSU和2019年PBO的绩效目标已在84目标水平的%，并相应地确认费用。因此，502019年第一季度归属的2019年PSU和PBO的股份比例50%
19

2019年第一季度归属的2019年PSU和PBO相关股份的比例，每种情况下，以接受者在每个归属日期的继续服务为准。
基于股票的薪酬费用
基于股票的薪酬费用包括在未经审计的简明合并经营报表中，具体如下(以千计)：
 截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
 2021202020212020
研发$597 $471 $1,074 $894 
销售、一般和行政2,247 1,468 4,457 3,214 
*总计$2,844 $1,939 $5,531 $4,108 

下表按未经审计的精简合并操作报表中包括的安全类型列出了基于股票的薪酬费用总额(以千为单位)：
 截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
 2021202020212020
股票期权$682 $575 $1,347 $1,116 
RSU和RSA690 610 1,232 1,210 
PSU573 296 1,043 627 
PBO899 458 1,909 1,155 
*总计$2,844 $1,939 $5,531 $4,108 
截至2021年6月30日，未确认的基于股票的薪酬支出，扣除预期没收，为#美元。4.8与未归属股票期权相关的百万美元，$4.7与未授权的RSU和RSA相关的百万美元，$1.9百万Re晚于未授权的PSU，以及$3.3百万相关根据目前对业绩水平的估计，向未授权的PBO提供资金。基于股票的薪酬例如这些奖项的奖金将在一年内获得认可。f 2025.
注9.股本
期权的行使
截至2021年6月30日和2020年6月30日的6个月，我们发布了212,631和32,749分别以加权平均行权价$行使期权时的股票8.03及$6.03每股，净现金收益为$1.7百万美元和$0.2分别为百万美元。
股权分配协议
我们向美国证券交易委员会提交了一份S-3表格的注册声明，根据该声明，我们可以在一个或多个产品中出售普通股、优先股、债务证券、认股权证、购买合同和单位。登记声明于2021年5月7日生效。2021年5月，我们与Piper Sandler&Co(“PSC”)签订了股权分销协议(“EDA”)，根据该协议，PSC作为我们的独家代理，可在我们不时决定的时间出售三年制由签署经济授权书起至最高限额为$的期间。50.0我们普通股的百万股。根据EDA的条款，PSC可以按照1933年“证券法”(经修订)第415条的规定，以任何被视为“在市场上发行”的方式以市价出售股票。
在EDA期间，我们不需要在任何时候出售任何股票。EDA将在以下两者中较早者终止：(I)根据EDA的条款和条件通过PSC发行和出售所有股票，或(Ii)根据EDA的条款终止EDA。任何一方在根据EDA向另一方发出书面通知后，均可随时终止EDA，一经通知，要约即告终止。在任何情况下，在证券交易委员会首次宣布注册声明生效三年后，不得根据EDA出售任何股票。我们同意向PSC支付3根据EDA出售的任何股票的销售总价的%。除某些费用外，我们将向PSC支付最高8根据EDA出售的股票的销售总价的%，用于支付佣金和PSC的费用和费用的综合金额。
20

在截至2021年6月30日的三个月和六个月内，不是我们普通股的股票是根据EDA发行的。截至2021年6月30日，美元50.0根据EDA，仍有100万股票可用。
注10。承诺和或有事项
经营租约
我们的总部位于加利福尼亚州的红杉市，在那里我们占据了大约30%的空间。77,300大都会人寿保险公司(“大都会人寿”)同一商业园内多幢大楼的办公及实验室面积均为平方英尺。我们与大都会人寿的租赁协议(“RWC Lease”)包括28,2002平方英尺的空间，位于加利福尼亚州雷德伍德市佩诺斯科特大道200号和220号(“200/220佩诺斯科特空间”)，大约37,900位于加利福尼亚州雷德伍德市佩诺斯科特大道400号的一平方英尺空间(“400佩诺斯科特空间”)(200/220佩诺斯科特空间和400佩诺斯科特空间统称为“佩诺斯科特空间”)，大约11,200位于加利福尼亚州雷德伍德市切萨皮克大道501号的50平方英尺的空间(“501切萨皮克空间”)。
到2020年1月底，我们还租赁了大约29,900位于加利福尼亚州雷德伍德市萨吉诺大道101号的一平方英尺空间(“萨吉诺空间”)。在2020年1月期间，我们大约转租了26,500向Minerva Surgical，Inc.出售萨吉诺空间的一平方英尺。萨吉诺空间的租赁和分租均于2020年1月底到期。在2020年2月1日至2020年4月30日期间，我们转租了大约3,400来自Minerva Surgical，Inc.的Saginaw Drive 101平方英尺。转租于2020年4月底到期。
我们于2004年与大都会人寿就我们在红木城的设施订立初步租约，其后RWC租约已多次修订，以调整租约的租赁空间及条款。于2019年2月，吾等与大都会人寿就Penobskt Space及501 Chesapeake Space订立租约第八项修订(“第八项修订”)，以延长租约期限。根据第八修正案，佩诺斯科特空间的租约期限已延长至2027年5月。501切萨皮克空间的租赁期已延长至2029年5月。我们有一(1)选择将Penobcot空间的租期延长五年(5)年，以及一(1)另行选择将501号切萨皮克车位的租期延长五年(5)年。
我们被要求将我们租用的红杉城设施的某些区域恢复到原来的形式。我们正在根据各自的租约条款支出资产报废义务。我们在每个报告期都会审核估计债务，如果我们的估计发生变化，我们会进行调整。我们记录的资产报废债务为#美元。0.2截至2021年6月30日和2020年12月31日的600万美元，计入未经审计的简明合并资产负债表中的其他长期负债。在截至2021年6月30日和2020年6月30日的三个月和六个月里，与我们的资产报废义务相关的增值费用是象征性的。
根据RWC租赁条款，我们行使了以信用证代替保证金的权利。信用证以银行持有的存款余额为抵押，金额为#美元。1.1截至2021年6月30日和2020年12月31日的600万美元，并在未经审计的精简合并资产负债表上记录为非流动限制性现金。
我们于2021年第二季度在加利福尼亚州圣卡洛斯签订了一份短期写字楼租约，租约将于2022年4月到期。根据本租约，我们未来剩余的承诺额为$0.1截至2021年6月30日，1.2亿美元。
融资租赁
2016年12月，我们达成了一项三年制与第三方供应商签订的购买实验室设备的融资租赁协议，部分资金来自#美元的融资租赁。0.4百万美元。租赁自2017年2月设备交付之日起生效，租期为三年制租约从2017年2月开始，2020年2月到期。这项融资协议是作为融资租赁入账的，因为租赁结束时有讨价还价的购买选择权。2017年4月，我们达成了一项三年制与第三方供应商签订的购买信息技术设备的融资租赁协议，价格为#美元。0.3百万美元。的有效期限三年制租约从2017年5月开始，2020年4月到期。
21

租赁和其他信息
租赁费用、计量租赁义务的金额以及与不可取消的经营租赁和融资租赁有关的其他信息如下(以千计)：
截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
 2021202020212020
融资租赁成本：
使用权资产摊销$27$45$53$99 
租赁义务利息—1—1 
融资租赁成本274653100
经营租赁成本1,033 1,032 2,065 2,100 
短期租赁成本(1)
10 16 10 47 
转租收入— — — (55)
总租赁成本 (2)
$1,070 $1,094 $2,128 $2,192 
(1) 租期在一个月以上、一年以下的短期租赁费。
(2)该公司拥有不是可变租赁成本。

其他信息：经营租约
加权-平均剩余租期(以年为单位)6.2年份
加权平均贴现率6.6 %
截至6月30日的六个月，
已支付现金：20212020
营业租赁的营业现金流$2,093 $774 
融资租赁产生的现金流$— $60 
截至2021年6月30日，我们对不可取消经营租赁的年度未贴现现金流的到期日分析如下(单位：千)：
截至12月31日的年度，经营租约
2021年(剩余6个月)$2,104 
20224,285 
20234,589 
20244,726 
20254,868 
此后8,626 
最低租赁付款总额29,198 
减去：推定利息5,534 
租赁义务$23,664 
未来租赁承诺
在2021年第一季度，我们与ARE-San Francisco No.63，LLC(“ARE”)签订了租赁协议，租赁了一个设施的一部分，该设施包括大约36,593位于加利福尼亚州圣卡洛斯的可出租平方英尺，用作额外的办公和研发实验室空间(“圣卡洛斯空间”)。我们预计，一旦承租人的改善工作基本完成，圣卡洛斯空间将于2021年11月开始使用。预算提供净租户改善津贴#美元。6.31000万美元，以及最高可达$1的额外津贴2.71000万美元，我们预计会用到这笔钱。Are将有权通过额外津贴的租赁期以一定的利率以每月相等的额外租金的形式获得我们的强制付款。这些条款包括初始的年化基本租金为#美元。2.52000万美元，以预定时间为准3每年租金上涨%，按年计算的额外津贴
22

支付$0.4百万美元，外加一定的运营费用。租约上有一项10-自租赁开始之日起计的一年期限一选择将期限再延长一段时间5好几年了。我们为他们提供了$0.51000万保证金，以信用证形式存入。如果房东同意，我们有权转租该设施。我们确定租赁开始日期为2021年11月，届时我们将记录使用权资产和相应的租赁负债。
租赁年度未贴现现金流的估计到期日分析如下(单位：千)：
截至12月31日的年度，经营租赁
2021年(剩余6个月)$— 
20222,463 
20232,988 
20243,066 
20253,145 
2026年及其后20,061 
最低租赁付款总额$31,723 
其他承诺
我们在正常的业务过程中达成供货和服务安排。供应安排主要是针对固定价格的制造和供应。服务协议主要用于开发制造流程和某些研究。服务协议下的承诺可由我们酌情取消，这可能需要支付某些取消费用。完成服务安排的时间取决于对完成工作所需时间的估计变化。
下表提供了有关我们其他承诺的定量数据。未来最低付款反映我们预期支付的金额，包括服务协议下的潜在义务，受我们取消风险的影响(以千为单位)：
其他承诺协议类型协议日期未来最低还款额
制造和供应协议，预计未来付款日期为2022年12月2016年4月$162 
开发和制造服务协议2019年9月1,852 
其他承付款总额$2,014 
信贷安排
2017年6月30日，我们与西联银行签订了一项由不超过#美元的定期贷款(“定期债务”)组成的信贷安排(“信贷安排”)。10.0百万美元，以及循环信贷额度(“循环信贷额度”)下的垫款(“垫款”)，最高可达#美元。5.0百万美元，应收账款借款基数为80符合条件的应收账款的百分比。截至2021年6月30日和2020年12月31日，我们尚未从信贷安排中提取资金。我们可以分别在2021年10月1日和2024年10月1日之前的任何时间提取定期债务和循环信用额度。2024年10月1日，根据定期债务提取的贷款到期，循环信用额度终止。根据债务期限发放的贷款在到期日计息，等同于(I)中的较大者。3.75%或(Ii)(A)指数利率(在《华尔街日报》西部版货币利率部分公布的最优惠利率)加(B)之和0.50%。根据循环信贷额度提供的预付款计入可变年利率，年利率等于(I)中的较大者。4.25%或(Ii)(A)最优惠利率加(B)之和1.00%.
我们在信贷机制下的义务以对我们除知识产权以外的几乎所有个人财产的留置权作为担保。信贷安排包括一些惯例契约和限制性金融契约，包括达到最低产品收入水平和与贷款人保持一定的最低现金水平。信贷安排的财务契约限制本公司转让抵押品、招致额外债务、进行合并或收购、支付股息或进行其他分配、进行投资、设立留置权、出售资产或出售在外国子公司持有的某些资产的能力。如果不遵守这些契约，可能会允许贷款人对我们和担保信贷安排的抵押品行使补救措施，包括取消我们的财产的抵押品赎回权，担保信贷安排和我们的现金。截至2021年6月30日，我们遵守了信贷安排契约。
23

信贷安排允许在2022年11月1日之前只支付定期债务的利息。在适用的摊销日期之后，要求每月支付定期债务的本金和利息。我们可以在任何时候选择全额偿还循环信用额度下的定期债务和预付款。
法律程序
我们目前不是任何重大待决诉讼或其他重大法律程序的当事人。
弥偿
我们必须确认我们在出具担保时所承担的任何义务的公允价值的责任。我们与许可方、被许可方和合作者签订了包含赔偿条款的特定协议。在此类条款中，我们通常同意就某些类型的第三方索赔向许可方、被许可方和合作者提供赔偿。赔偿的最高金额不受限制。当损失可能发生并且可以合理估计时，我们会为已知的赔偿问题应计。有几个不是列示的任何期间与赔偿问题有关的费用的应计费用。
注11.关联方交易
分子组装公司
在2020年6月，我们与MAI签订了一份股票购买协议，根据该协议，我们购买了1,587,050麦氏A系列优先股作价$1.02000万。在这笔交易中，我们的总裁兼首席执行官约翰·尼科尔斯也加入了Mai的董事会。在进行初始股权投资的同时，我们与mai签订了mai协议，根据该协议，我们将利用我们的CodeEvolver提供服务。®蛋白质工程平台技术改善DNA聚合酶，以换取以增发麦氏A系列优先股的形式进行补偿。2021年4月，我们额外购买了一台1,000,000麦氏A系列优先股作价$0.6百万美元。
我们认出了$0.3300万美元和300万美元0.5在截至2021年6月30日的三个月和六个月里，我们分别从与MAI的交易中获得了1000万美元的研发收入，我们认识到不是截至2020年6月30日的三个月和六个月，与MAI进行的研发服务交易的收入。我们收到了714,171和1,428,342MAI的A系列优先股，来自我们在2005年向MAI提供的研发服务分别截至2021年6月30日的三个月和六个月，以及不是在截至2020年6月30日的三个月和六个月里，麦氏从研发服务获得的A系列优先股的股票。截至2021年6月30日，我们有5,443,734自与麦氏签订购股协议以来，麦氏A系列优先股的股份。我们对MAI系列A优先股的投资账面价值为$3.4300万美元和300万美元1.52021年6月30日和2020年12月31日分别为3.5亿美元。我们有一块钱0.4百万和零截至2021年6月30日和2020年12月31日的递延收入，以及零及$0.5截至2021年6月30日和2020年12月31日，MAI应支付的合同资产分别为100万美元。所提供服务的付款是以额外的MAI系列A优先股的形式收到的。
阿斯利康
Pam P.Cheng在2020年6月之前一直担任我们的董事会成员，他于2015年6月加入阿斯利康，担任运营和信息技术部执行副总裁。我们将生物催化剂产品销售给阿斯利康及其受控采购商和代工厂。我们认出了$20一千美元0.1截至2020年6月30日的三个月和六个月，以及程女士离开董事会之日，来自与阿斯利康及其受控采购代理和代工制造商的交易收入为1000万美元。截至2021年6月30日和2020年12月31日，我们有不是阿斯利康及其受控代购和代工企业的应收账款分别来自关联方交易。
注12。细分市场、地理位置和其他收入信息
段信息
我们将我们的业务管理为二业务细分：性能酶和新型生物疗法。我们的首席运营决策者(“CODM”)是我们的首席执行官。我们的业务部门主要基于我们的组织结构和我们的运营结果，我们的CODM在评估业绩和为公司分配资源时使用了这些结果。
24

我们报告与公司相关的费用，如法律、会计、信息技术和其他成本，这些费用没有包括在我们的可报告业务部门中，称为“公司成本”。所有不包括在营业收入(亏损)中的项目都不包括在业务部门中。
我们在整个公司的基础上管理我们的资产，而不是按业务部门管理，因为我们的大部分运营资产是共享或混合的。我们的CODM在评估业绩或分配资源时不按业务部门审查资产信息，因此，我们不按业务部门报告资产信息。
性能酶
我们最初将CodeEvolver商业化®我们在制药市场拥有蛋白质工程技术平台和产品，到目前为止，这仍然是我们服务的最大市场。我们的客户，包括许多大型全球制药公司，在他们的制造过程和过程开发中使用我们的技术、产品和服务。我们还利用这项技术开发了定制的酶，供其他工业市场使用。这些市场由几个大型工业垂直市场组成，包括食品和食品配料、动物饲料、香料、香料和农用化学品。我们还利用我们的技术为客户开发使用NGS和PCR/qPCR的酶，用于体外分子诊断和分子生物学研究应用。
新型生物疗法
我们还瞄准了制药业的新机会，以发现、改进和/或开发生物治疗药物候选药物。我们相信我们的CodeEvolver®蛋白质工程平台技术可以用来发现新的生物治疗药物候选药物，这些药物将针对需要改进治疗干预的人类疾病。同样，我们相信，我们可以利用我们的平台技术来改善客户已有的生物治疗候选药物的具体特性，如活性、稳定性或免疫原性。最值得注意的是我们针对人类PKU潜在治疗的牵头项目。PKU是一种遗传性代谢紊乱，将必需氨基酸苯丙氨酸转化为酪氨酸的酶缺乏。
我们还开发了其他生物治疗候选药物的流水线，这些药物正在进行临床前开发，我们预计将继续进行额外的投资，目的是推动针对其他治疗领域的更多候选产品。2020年3月，我们与武田签订了武田协议，根据协议，我们将研究和开发用于某些疾病的基因治疗产品的蛋白质序列。
在确定二该公司的可报告部门包括业务活动的性质、直接向我们的CODM负责经营和行政活动的管理结构、离散财务信息的可用性以及提交给董事会的信息。我们的CODM定期审查我们的部门以及管理层为绩效评估和资源分配提供的方法。
直接支持分部活动的运营费用根据分部内业务单位的分部人数、收入贡献或活动分配，基于提供给分部的公司活动类型。费用分配不包括与细分市场分开管理的某些公司成本。这为CODM提供了更有意义的部门盈利报告，以支持运营决策和分配资源。
25

下表提供了按我们的可报告业务部门划分的财务信息，以及与所得税前综合收益(亏损)的对账(以千为单位)：
截至2021年6月30日的三个月截至2020年6月30日的三个月
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计
收入：
产品收入$14,717 $— $14,717 $4,504 $— $4,504 
研发收入6,868 3,868 10,736 3,002 7,461 10,463 
总收入21,585 3,868 25,453 7,506 7,461 14,967 
成本和运营费用：
产品收入成本4,318 — 4,318 1,699 — 1,699 
研发(1)
5,057 7,194 12,251 4,997 5,490 10,487 
销售、一般和行政(1)
3,170 620 3,790 2,375 621 2,996 
部门总成本和运营费用12,545 7,814 20,359 9,071 6,111 15,182 
营业收入(亏损)$9,040 $(3,946)5,094 $(1,565)$1,350 (215)
企业成本(2)
(8,610)(5,316)
未分配折旧和摊销(741)(506)
所得税前亏损$(4,257)$(6,037)
截至2021年6月30日的6个月截至2020年6月30日的6个月
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计
收入：
产品收入$24,943 $— $24,943 $9,604 $— $9,604 
研发收入10,872 7,670 18,542 8,775 11,258 20,033 
总收入35,815 7,670 43,485 18,379 11,258 29,637 
成本和运营费用：
产品收入成本8,536 — 8,536 4,240 — 4,240 
研发(1)
11,502 11,799 23,301 10,693 10,415 21,108 
销售、一般和行政(1)
5,988 1,221 7,209 4,720 1,213 5,933 
部门总成本和运营费用26,026 13,020 39,046 19,653 11,628 31,281 
营业收入(亏损)$9,789 $(5,350)4,439 $(1,274)$(370)(1,644)
企业成本(2)
(16,335)(11,042)
未分配折旧和摊销(1,426)(998)
所得税前亏损$(13,322)$(13,684)
(1)研发费用和销售、一般和行政费用不包括融资租赁的折旧和摊销。
(2)公司成本包括未分配的销售、一般和行政费用、利息收入和其他收入(费用)，净额。
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下表提供了包含在运营收入(亏损)中的基于股票的薪酬费用(以千为单位)：
截至6月30日的三个月，
20212020
性能酶新型生物疗法企业成本总计性能酶新型生物疗法企业成本总计
基于股票的薪酬$1,115 $257 $1,472 $2,844 $741 $252 $946 $1,939 
截至6月30日的六个月，
20212020
性能酶新型生物疗法企业成本总计性能酶新型生物疗法企业成本总计
基于股票的薪酬$2,109 $495 $2,927 $5,531 $1,496 $494 $2,118 $4,108 
重要客户
每个客户占我们总收入的10%或更多的客户如下：
占总收入的百分比
截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
2021202020212020
客户A15%*10%*
客户B12%***
客户C12%*13%*
客户D*16%17%20%
客户E*38%10%27%
客户费用*12%*11%
客户G***13%
*百分比低于10%
截至下列期间各占应收账款余额10%或以上的客户如下：
截至的应收账款百分比
2021年6月30日2020年12月31日
客户A20%*
客户H15%*
客户B15%*
客户D14%32%
客户E10%*
客户G*25%
客户费用*13%
*百分比低于10%




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地理信息
地理收入由客户所在地确定，由以下内容组成(以千为单位)：
 截至6月30日的三个月，截至6月30日的六个月，
2021202020212020
收入
美洲$5,844 $6,906 $10,773 $12,131 
欧洲、中东和非洲地区6,169 3,314 12,450 9,285 
APAC13,440 4,747 20,262 8,221 
总收入$25,453 $14,967 $43,485 $29,637 
按地点划分的可识别长期资产如下(以千为单位)：
2021年6月30日2020年12月31日
美国$31,424 $31,176 
按报告单位分列的可识别商誉如下(以千为单位)：
截至2021年6月30日和2020年12月31日
性能酶新型生物疗法总计
商誉$2,463 $778 $3,241 
注13.信贷损失准备
下表汇总了信贷损失的金融资产拨备(单位：千)：
2021年6月30日2020年12月31日
信贷损失拨备$74 74 
下表按账龄类别汇总应收账款(单位：千)：
2021年6月30日
当前31-60天61-90天91天及以上总余额
应收账款$17,414 $83 $1,602 $389 $19,488 
2020年12月31日
当前31-60天61-90天91天及以上总余额
应收账款$13,398 $489 $7 $— $13,894 

28

第二项。管理层对财务状况和经营成果的探讨与分析
以下管理层对我们财务状况和经营结果的讨论和分析应与本季度报告中其他地方的未经审计的简明综合财务报表及其相关附注、经审计的综合财务报表及其附注以及管理层对截至2020年12月31日止年度的财务状况和经营结果的讨论和分析一并阅读，这些报表包括我们于2021年3月1日提交给证券交易委员会的10-K表格年度报告(“年度报告”)中包含的未经审计的简明综合财务报表及其相关附注。这份关于Form 10-Q的季度报告包含符合修订后的1934年证券交易法(“交易法”)第21E节的前瞻性陈述。这些陈述包括但不限于对我们的战略、业务计划、财务业绩和与我们行业相关的发展的预期。这些陈述通常通过使用诸如“可能”、“将会”、“预期”、“相信”、“预期”、“打算”、“可能”、“应该”、“估计”或“继续”等词语以及类似的表达或变体来识别。此类前瞻性陈述会受到风险、不确定性和其他因素的影响，这些风险、不确定性和其他因素可能会导致实际结果和某些事件的时间与此类前瞻性陈述明示或暗示的未来结果大不相同。可能导致或导致这种差异的因素包括但不限于本季度报告的表格10-Q的第II部分第1A项：“风险因素”和年报第I部分的第1A项：“风险因素”中讨论的那些，如本文所述并在第II部分中引用。, 第1A项：本季度报告中表格10-Q和本报告其他部分的“风险因素”。本季度报告中关于Form 10-Q的前瞻性陈述代表我们截至本Form 10-Q季度报告发布之日的观点。我们预计，随后发生的事件和事态发展将导致我们的观点发生变化。但是，虽然我们可能会选择在未来某个时候更新这些前瞻性声明，但除非适用法律要求，否则我们目前无意这样做。因此，您不应依赖这些前瞻性陈述作为截至本10-Q表格季度报告日期之后的任何日期我们的观点。
业务概述
我们在越来越多的行业中发现、开发和销售为客户提供价值的酶和其他蛋白质。我们认为蛋白质是一个巨大的、在很大程度上尚未开发的创造价值的产品来源，我们正在利用我们自2002年成立以来一直在不断改进的成熟技术，将越来越多的新型酶商业化，无论是作为Codexis专利产品还是与我们的客户合作。
我们是利用计算技术推动生物进步的先驱。自2002年以来，我们在CodeEvolver的开发上投入了大量资金®蛋白质工程技术平台，是我们竞争优势的主要来源。我们的技术平台由基于人工智能的专有计算算法提供支持，这些算法可以快速挖掘我们庞大且不断增长的蛋白质变异库的结构和性能属性。这些计算输出使下一代蛋白质变体的工程预测变得越来越可靠，从而实现了具有时间和成本效益的目标性能增强。除了强大的计算能力，我们的CodeEvolver®蛋白质工程技术平台整合了额外的模块能力，包括机器人高通量筛选和基因组测序、有机化学和生物过程开发，所有这些都是协调一致的，以快速创新适合用途的新型产品。
这项技术的核心历史应用一直是开发商业上可行的生物催化制造工艺，以便更可持续地生产复杂化学品。首先，从概念上为目标产品设计最具成本效益和最实用的流程。然后，我们使用CodeEvolver开发优化的生物催化剂来实现设计的过程®站台。工程生物催化剂候选者，每个项目有数千人，然后在与工艺相关的操作条件下使用高通量方法进行快速筛选和验证。这种方法产生了一种优化的生物催化剂，使得在传统制造设备中运行相对简单的成本效益过程成为可能。这也使得我们能够高效地将我们的工艺技术转让给我们的制造合作伙伴。
我们的CodeEvolver的成功体现®商业制造过程中的蛋白质工程技术平台需要多个技术学科的专业知识很好地整合。除了直接集成到我们的CodeEvolver中的那些能力之外®除了分子生物学、酶学、微生物学、细胞工程、代谢工程、生物信息学、生物化学和高通量分析化学等蛋白质工程平台外，我们的工艺开发项目还涉及有机化学、化工工艺开发、化学工程、生物工艺开发和发酵工程方面的综合专业知识。我们综合的、多学科的产品和流程开发方法是公司成功的关键因素。
我们最初将CodeEvolver商业化®小分子药物制造中的蛋白质工程技术平台和产品，这仍然是一个主要的业务重点。我们的客户，其中包括许多大型的、全球性的
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我们的技术、产品和服务可用于制药公司的工艺开发和制造。此外，我们还授权使用我们专有的CodeEvolver®为全球制药公司提供蛋白质工程技术平台，使它们能够在内部使用这项技术，为自己的业务设计酶。最近一次是在2019年5月，我们加入了诺华CodeEvolver®与诺华公司达成协议。诺华公司的CodeEvolver®协议(我们与大型制药公司的第三份此类协议)允许诺华公司使用我们专有的CodeEvolver®蛋白质工程平台技术在人类保健领域的应用。
作为我们将技术扩展到制药以外的战略的证据，我们还利用该技术开发了生物催化剂和酶产品，用于更广泛的工业市场，包括几个大型垂直市场，如食品、饲料、消费者护理和精细化学品。此外，我们正在利用我们的技术为各种与生命科学相关的应用开发酶，例如用于体外分子诊断和基因组研究的下一代测序(“NGS”)和聚合酶链式反应(“PCR/qPCR”)。2019年12月，我们签订了一项许可协议，向罗氏测序解决方案公司提供我们针对这一目标市场的第一种酶：该公司的EvoT4™DNA连接酶。2020年6月，我们与Alphazyme LLC签订了一项联合营销和酶供应合作协议，生产和联合营销用于生命科学应用的酶，最初包括高保真DNA聚合酶、T7RNA聚合酶和逆转录酶。
我们一直在使用CodeEvolver®蛋白质工程技术平台与客户合作开发早期的新型生物治疗候选产品，并为我们自己的Codexis专利候选药物提供技术支持。我们的第一个项目是针对人类苯丙酮尿症(“PKU”)的潜在治疗。PKU是一种遗传性代谢紊乱，将必需氨基酸苯丙氨酸转化为酪氨酸的酶缺乏。2017年10月，我们与雀巢健康科学签订了雀巢许可协议，以推动我们的酶生物治疗产品CDX-6114的发展，CDX-6114可用于潜在的PKU治疗。2019年2月，雀巢健康科学行使选择权，获得CDX-6114的独家开发和商业化许可。同样在2017年10月，我们签署了雀巢SCA，根据该协议，我们和雀巢健康科学正在合作利用CodeEvolver®为雀巢健康科学已有的消费者护理和医疗营养业务领域开发其他新型酶的平台技术。2020年1月，我们与雀巢健康科学签订了一项开发协议，将雀巢SCA中发现的一种新的主要候选药物CDX-7108推向临床前开发和早期临床研究，作为一种潜在的胃肠道疾病治疗方法。与此同时，雀巢SCA延长至2021年12月，以支持发现治疗其他疾病的候选药物。2020年3月，我们与武田的全资子公司Shire Human Genetic Treatations，Inc.签订了武田协议，以研究和开发针对某些疾病适应症的新型基因疗法，包括治疗溶酶体储存障碍和血因子缺乏症。
在2020年6月，我们与分子组装公司(“MAI”)签订了MAI协议，根据该协议，我们正在利用我们的CodeEvolver®平台技术，以改进DNA聚合酶，这些酶对酶促DNA合成至关重要。与MAI协议同时，我们与MAI签订了股票购买协议，根据该协议，我们以100万美元购买了1,587,050股MAI的A系列优先股，与该交易相关，我们的总裁兼首席执行官John Nicols也加入了MAI的董事会。2021年4月，我们以60万美元额外购买了100万股麦氏A系列优先股。我们预计在2021年下半年完成与MAI的酶工程项目，这可能使MAI在此后开始商业化努力。
业务部门
我们将我们的业务分为两个业务部门：性能酶和新型生物疗法。请参阅本季度报告Form 10-Q中未经审计的简明综合财务报表附注中的附注12，“分部、地理和其他收入信息”。
性能酶
我们最初将CodeEvolver商业化®蛋白质工程技术平台和产品在小分子药物制造中发挥着重要作用，到目前为止，这仍然是我们服务的最大市场。我们的客户，包括许多大型全球制药公司，在他们的制造过程和过程开发中使用我们的技术、产品和服务。我们还利用这项技术开发了定制的酶，供其他工业市场使用。这些市场由几个大型工业垂直市场组成，包括食品、饲料、消费者护理和精细化学品。我们还将我们的技术用于生命科学市场，为客户开发使用NGS和PCR/qPCR的酶，用于体外分子诊断和分子生物学研究应用，以及DNA/RNA合成和健康监测应用。
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新型生物疗法
我们还瞄准了制药业的新机会，以发现、改进和/或开发生物治疗药物候选药物。我们相信我们的CodeEvolver®蛋白质工程平台技术可以用来发现新的生物治疗药物候选药物，这些药物将针对需要改进治疗干预的人类疾病。同样，我们相信，我们可以利用我们的平台技术来改善客户已有的生物治疗候选药物的具体特性，如活性、稳定性或免疫原性。我们的第一个主导项目是针对人类PKU的潜在治疗。PKU是一种遗传性代谢紊乱，将必需氨基酸苯丙氨酸转化为酪氨酸的酶缺乏。2017年10月，我们宣布与雀巢健康科学公司达成一项全球开发、选择和许可协议，以推动我们自己的新型口服给药酶疗法候选药物CDX-6114的发展，CDX-6114可用于潜在的PKU治疗。2019年2月，雀巢健康科学行使其选择权，获得了CDX-6114在全球范围内的独家、特许权使用费、可再许可的许可，用于管理PKU的CDX-6114的全球开发和商业化。作为期权行使的结果，我们在2019年第一季度获得了一个里程碑，确认了300万美元的收入。在行使选择权后，雀巢健康科学公司承担了CDX-6114未来临床开发和商业化的所有责任。2020年，雀巢健康科学公司在PKU患者中完成了CDX-6114的安全性、耐受性和PK/PD研究，证明CDX-6114在测试的所有剂量下都具有良好的耐受性和安全性。此外，观察到血液中肉桂酸的水平增加，肉桂酸是酶活性的生物标志物，这与CDX-6114的预期作用模式是一致的。
2017年10月，我们分别与雀巢健康科学签订了雀巢SCA，据此，我们和雀巢健康科学正在合作利用CodeEvolver®为雀巢健康科学已有的消费者护理和医疗营养业务领域开发其他新型酶的平台技术。雀巢SCA延长至2021年12月。2020年1月，我们和雀巢健康科学公司达成了一项开发协议，根据该协议，我们和雀巢健康科学公司正在合作，针对通过雀巢SCA发现的一种胃肠道疾病CDX-7108进行临床前和早期临床研究。在2021年期间，我们与雀巢健康科学一起，继续推进CDX-7108，以启动一期临床试验，我们预计该试验将于2021年第四季度开始。此外，各方正在根据雀巢SCA推进三个针对不同胃肠道疾病的项目。
2020年3月，我们签订了武田协议，根据该协议，我们正在根据针对Fabry病、Pompe病和一种未披露的血因子缺乏症的各自项目计划，合作研究和开发用于某些疾病适应症的基因治疗产品的蛋白质序列。2020年3月，我们收到了850万美元的一次性、不可退还的现金付款。在这些计划中，Fabry病计划是最先进的，已经向武田提供了包括CDX-6311在内的多个序列。2021年5月，武田选择行使他们的选择权，为某种未披露的罕见遗传病启动额外的计划，因此我们有资格获得选择权行使费。
欲进一步说明我们的业务部门，请参阅本季度报告10-Q表格中未经审计的综合财务报表附注中的注12，“部门、地理和其他收入信息”。
新冠肺炎相关商业动态
当前的新冠肺炎大流行给我们带来了风险和不确定性。新冠肺炎疫情给世界各地的公共卫生和经济带来了巨大的挑战，正在影响我们的员工、社区和业务运营，以及美国经济和世界各地的其他经济体。新冠肺炎疫情将在多大程度上直接或间接影响我们的业务、运营业绩和财务状况，将取决于未来的发展情况，这些事态发展具有很高的不确定性，可能无法准确预测，包括疫情的持续时间和严重程度，更具传染性和或毒性的变种的流行程度，以及对客户的影响的程度和严重程度，可能出现的有关新冠肺炎的新信息，为遏制疫情或治疗其影响而采取的行动，以及对当地、地区、国家和国际市场的经济影响。
到目前为止，我们和我们的合作伙伴能够继续向全球客户供应我们的酶。然而，我们依赖于我们的制造和物流合作伙伴，因此，我们合作伙伴和客户的运营中断可能会影响我们向客户供应酶的能力。此外，我们提供未来研发(R&D)服务的能力将继续受到政府订单和与我们合作的客户运营中断的影响。我们认为，这些中断对截至2021年6月30日的三个月和六个月的收入影响微乎其微。大流行可能对我们的业务运作和经营业绩造成多大程度的影响，仍将高度取决于未来的事态发展，这些事态发展是不确定的，也不能有把握地预测。
31

在美国，新冠肺炎的影响，包括大流行期间管理企业运营的政府命令(下称“命令”)，导致我们位于加利福尼亚州红杉市的工厂暂时关闭，并扰乱了我们的研发业务。根据这些命令，从2020年3月中旬到2020年4月底，几个项目的研发作业暂时停止。2020年5月，我们重新启动了有限的研发业务，并加大了运营力度，目前我们正在利用大部分正常的研发能力，同时遵循县、州和联邦新冠肺炎保护员工的指导方针。此外，我们于2020年5月恢复了红杉城试点工厂的生产。
我们未来的经营业绩和流动性可能会受到超出正常付款条件的未偿还应收账款的延迟支付、供应链中断和不确定的需求，以及我们可能采取的任何解决客户面临的财务和运营挑战的计划或计划的影响。新冠肺炎对我们未来的财务状况、流动性或运营结果的近期和长期影响仍不确定。尽管为控制新冠肺炎传播而颁布的一些命令已经开始缩减，疫苗推出也已经扩大，但由于出现新的更具传染性或致病性的变种或针对这些毒株的疫苗无效而导致的新冠肺炎传播激增，可能会导致某些命令重新执行，这可能会对我们的业务产生不利影响。有关新冠肺炎大流行构成的各种风险的更多信息，请阅读项目1A。风险因素包含在我们于2021年3月1日提交的截至2020年12月31日的财政年度Form 10-K年度报告中。
运营结果概述
2021年第二季度营收为2550万美元，较2020年第二季度的1500万美元增长70%。
产品收入，主要包括生物催化剂、医药中间体和食典的销售®2021年第二季度，生物催化剂面板和套件为1470万美元，比2020年第二季度的450万美元增长了227%。产品收入增加的主要原因是客户对品牌医药产品的需求增加。我们预计今年剩余时间对我们产品的需求将高于去年同期，主要是因为对品牌医药产品制造中使用的酶的总体需求较高，以及我们在2021年6月从一家制药客户那里收到的价值1390万美元的专有高酶产品的大笔采购订单，该订单将在随后的几个时期确认为收入。
2021年第二季度，研发收入总计1070万美元，与2020年第二季度的1050万美元相比，增长了3%。研发收入包括许可费、技术访问费和排他费、研究服务费、里程碑付款、特许权使用费以及优化和筛选费用。研究和开发收入的增长主要是由于其他现有合作协议的许可费增加，但被武田根据武田协议增加的许可费部分抵消，武田协议的许可费在上一年同期得到确认。
我们产品的盈利能力受到许多因素的影响，包括我们销售的产品的利润率。我们的利润率受到许多因素的影响，包括内部和第三方固定和可变成本的成本，包括材料和用品、劳动力、设施和其他间接成本。利润率数据被用作管理业绩衡量标准，以便在综合基础上提供有关我们运营结果的附加信息。2021年第二季度产品毛利率增至71%，而2020年第二季度为62%，原因是由于客户对品牌产品需求的增加，改善了产品组合。
2021年第二季度的研发费用为1280万美元，比2020年第二季度的1090万美元增长了18%。这一增长主要是由于增长所致。在与员工人数增加相关的费用中，外部服务成本增加、折旧费用增加和实验室用品成本增加被与化学、制造和控制相关的外部服务(“CMC”)和监管费用的减少以及可分配费用的减少部分抵消。我们预计今年剩余时间的研发费用将高于上年同期，这主要是由于员工人数的增加，以及我们继续努力推进我们的内部和合作计划。
第二季度销售、一般和行政费用为1280万美元到2021年，与2020年第二季度的850万美元相比，增长了50%。这一增长主要是由于与增加员工人数、法律费用和基于股票的薪酬相关的费用增加，部分被较低的差旅和可分配费用所抵消。我们预计今年剩余时间的销售、一般和行政费用将高于上年同期，主要原因是员工人数增加和运营成本上升。It‘我们在业务上投入了更多的资金.
由于历史上不确定的税收状况的利息和罚款的应计费用，我们在2021年第二季度确认了8000美元的所得税支出。我们认出了一个30万美元2020年第二季度所得税拨备
32

由于外国税务机关对在美国以外的某些国家赚取并汇回美国的收入征收所得税预扣。
2021年第二季度净亏损为430万美元，或每股基本和稀释后净亏损0.07美元，而2020年第二季度净亏损为630万美元，或每股基本和稀释后净亏损0.11美元。净亏损的减少主要与产品收入和利润率的增加有关，但这一增长被运营费用。
截至2021年6月30日，现金和现金等价物降至1.295亿美元，而截至2020年12月31日的现金和现金等价物为1.491亿美元。此外，截至2021年6月30日的6个月，运营活动中使用的净现金为1470万美元，而截至2020年6月30日的6个月为1150万美元。我们相信，根据我们目前的运营水平，我们现有的现金和现金等价物将为持续运营、计划的资本支出和至少未来12个月的营运资本需求提供充足的资金。
2017年6月，我们与西联银行签订了一项贷款和担保协议，允许我们在定期贷款下借入最多1,000万美元，在以某些合格应收账款的80%作为借款基础的循环信贷安排(“信贷安排”)下借入最多500万美元。信贷机制下的债务以对我们的知识产权以外的几乎所有个人财产的留置权作为担保。2020年9月，我们达成了信贷安排的第八项修正案，根据该修正案，我们可以分别在2021年10月1日和2024年10月1日之前的任何时候动用定期债务和循环信贷额度。使用“债务”这一术语的人必须遵守融资的惯常条件，其中包括不存在违约事件。截至2021年6月30日，没有任何金额在信贷安排下借款，我们遵守了信贷安排的契约。请参阅本季度报告Form 10-Q中未经审计的简明综合财务报表附注中的附注10，“承付款和或有事项”。
以下是我们按业务部门划分的运营结果概述：
性能酶
2021年第二季度的收入增加了1410万美元，增幅为188%，达到2160万美元，而2020年第二季度的收入为750万美元，这主要是由于产品收入的增加。与2020年第二季度的450万美元相比，2021年第二季度的产品收入增加了1020万美元，增幅为227%，达到1470万美元，这主要是由于客户对用于制造品牌药品的酶的需求增加。我们预计今年剩余时间对我们产品的需求将高于去年同期，主要是因为对品牌医药产品制造中使用的酶的总体需求较高，以及我们在2021年6月从一家制药客户那里收到的价值1390万美元的专有高酶产品的大笔采购订单，该订单将在随后的几个时期确认为收入。
与2020年第二季度的300万美元相比，2021年第二季度研发收入增加了390万美元，增幅为129%，达到690万美元，主要原因是现有合作协议的许可费增加，但诺华CodeEvolver的收入下降部分抵消了这一增长® 在我们接近完成向诺华公司的技术转让时，我们达成了一项协议。
2021年第二季度产品毛利率为71%，而2020年第二季度为62%。产品毛利率的增长主要是由于品牌医药产品生产用酶的需求增加，从而改善了产品结构。.
与2020年第二季度相比，2021年第二季度的研发支出名义上增加了6万美元，增幅为1%，达到510万美元。增加的主要原因是与更多员工、更高的外部服务费用和更高的实验室用品相关的成本增加，但部分被较低的可分配费用所抵消。
与2020年第二季度相比，2021年第二季度的销售、一般和行政费用增加了80万美元，增幅为33%，达到320万美元。这一增长主要是由于N与更多员工和可分配费用相关的成本增加，但被较低的外部服务费用部分抵消。
我们预计今年剩余时间的研发费用以及销售、一般和行政费用都将高于上年同期，主要原因是员工人数增加和It‘我们在业务上投入了更多的资金.
新型生物疗法
2021年第二季度，研发收入减少了360万美元，降至390万美元，而2020年第二季度为750万美元。研究和开发收入的减少主要是由于武田根据上一年确认的武田协议提高了许可证和研发费用。
33

2021年第二季度，研发支出增加了170万美元，增幅为31%，达到720万美元，而2020年第二季度为550万美元。增加的主要原因是成本上升。与更高的员工人数和可分配费用相关。我们预计今年剩余时间的研发费用将高于上年同期，这主要是由于员工人数的增加，以及我们继续努力推进我们的内部和合作计划。
销售费用、一般费用和行政费用保持不变60万美元或者是2021年和2020年的第二季度。与员工人数和较高的可分配费用相关的成本增加被较低的外部服务费用部分抵消。
默克Sitagliptin催化剂供应协议
2012年2月，我们与默克公司签订了一份为期五年的希塔格利汀催化剂供应协议(“希塔利汀催化剂供应协议”)，根据该协议，默克公司可以获得商业规模的酶，用于制造Januvia®，其产品以活性成分西格列汀为基础。2015年12月，默克公司根据Sitagliptin催化剂供应协议的条款行使了选择权，将协议再延长五年，至2022年2月。
自2016年1月起，我们和默克公司修订了希塔格利丁催化剂供应协议，根据默克公司购买的西格利汀催化剂的累计数量，前瞻性地提供可变定价，并允许默克公司从指定的第三方供应商购买其西塔格利丁催化剂需求量的一定比例。默克公司从2018年1月1日起获得了独特的功能性许可，可以生产其部分需求，我们将其确认为研发收入。
我们已经确定，可变定价根据默克公司购买的Sitagliptin催化剂的累计数量提供折扣，为默克公司提供材料权利，我们正在使用替代方法确认产品收入。在另一种方法下，我们估计总的预期对价，并将其与预期销售额按比例分配。
Sitagliptin催化剂供应协议要求默克公司在Sitagliptin催化剂供应协议期限内每年为Sitagliptin技术的权利支付年费。每年的许可费是根据合同商定的价格计算的，在合同期限内呈下降趋势。
根据Sitagliptin催化剂供应协议的条款，默克可以根据合同规定的价格向我们购买供应。我们确认了收入220万美元和550万美元截至2021年6月30日的三个月和六个月，相比之下，根据本协议，截至2020年6月30日的三个月和六个月的产品收入分别为200万美元和380万美元。截至2021年6月30日的三个月和六个月，我们根据希塔格利汀催化剂供应协议确认的收入分别占我们总收入的9%和13%，而截至2020年6月30日的三个月和六个月的收入占我们总收入的13%。
Sitagliptin催化剂供应协议将于2022年2月到期。我们目前正在就延期进行谈判。
自.起2021年6月30日，我们记录了Sitagliptin产品的收入520万美元，这些产品根据制造过程的进展随着时间的推移而得到确认。这些产品将在季度末之后的六个月内发货。合同资产馀额由合同负债部分抵消，因为它们属于同一合同。
全球发展、选择权和许可协议和战略合作协议
2017年10月，我们与雀巢健康科学公司签订了雀巢许可协议，仅出于雀巢许可协议的整合和争议解决条款的目的，雀巢健康科学公司将推进我们的酶生物治疗产品CDX-6114，这是我们潜在治疗PKU的候选产品。
2019年1月，我们收到FDA的通知，它已经完成了对我们针对CDX-6114的IND的审查，并得出结论，我们可能会继续在美国健康志愿者中进行拟议的1b期多次递增剂量研究。2019年2月，雀巢健康科学行使其选择权，获得了CDX-6114在全球范围内的独家、特许权使用费、可再许可的许可，用于管理PKU的CDX-6114的全球开发和商业化。在行使选择权后，雀巢健康科学公司支付了选择权，并承担了CDX-6114未来临床开发和商业化的所有责任。根据雀巢许可协议，我们还有资格从雀巢健康科学公司获得付款，其中包括(I)开发和批准里程碑，金额高达8500万美元；(Ii)基于销售的里程碑，总计高达2.5亿美元，如果一年内净销售额超过10亿美元，则可实现总金额
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(三)按产品净销售额的中位数-个位数到较低的两位数的百分比的分级特许权使用费；以及(Iii)按产品净销售额的中位数-个位数到较低的两位数百分比的分级版税。
2017年10月，我们签署了雀巢SCA，根据该协议，我们和雀巢健康科学正在合作利用CodeEvolver®为雀巢健康科学成熟的消费者护理和医疗营养业务领域开发新型酶的蛋白质工程技术平台。
2020年1月，我们与雀巢健康科学公司签订了一项开发协议，根据该协议，我们和雀巢健康科学公司正在合作推进一种主要候选药物CDX-7108，目标是通过雀巢SCA发现的一种胃肠道疾病，进入临床前和早期临床研究。
根据雀巢SCA和开发协议，我们确认170万元和350万元截至2021年6月30日的三个月和六个月，分别为170万美元和330万美元，而截至2020年6月30日的三个月和六个月分别为170万美元和330万美元。
平台技术转让和许可协议
2019年5月，我们进入诺华CodeEvolver® 与诺华公司达成协议。该协议允许诺华公司使用我们专有的CodeEvolver®蛋白质工程平台技术在人类保健领域的应用。在诺华CodeEvolver下®协议，我们将把我们专有的CodeEvolver®从我们开始技术转让之日(“技术转让期”)开始，我们将在大约27个月的时间内向诺华公司转让蛋白质工程平台技术。作为这项技术转让的一部分，该公司向诺华公司提供了我们专有的酶、专有的蛋白质工程协议和方法以及专有的软件算法。此外，公司和诺华公司的科学家团队还在我们位于加利福尼亚州雷德伍德城的实验室和在瑞士巴塞尔的诺华指定实验室参加了技术培训课程和合作研究项目。技术转让完成后，诺华公司将拥有CodeEvolver®蛋白质工程平台技术安装在其指定的实验室。
根据协议，我们在诺华CodeEvolver生效日期后不久收到了500万美元的预付款®协议。在2020年第二季度，我们根据协议完成了第二次技术里程碑转让，并有资格获得400万美元的里程碑式付款，随后我们在2020年7月收到了这笔付款。我们还在2021年3月收到了340万美元，用于部分完成第三个技术里程碑。除了这笔付款外，我们还有资格获得160万美元的额外付款，用于完成第三次技术里程碑转让，这将使诺华CodeEvolver中规定的这一里程碑的现金支付总额达到500万美元®协议。考虑到在技术转让期(“改进期限”)结束后的多年期间内继续披露和许可对技术和材料的改进，诺华公司将每年向Codexis支付总计800万美元的额外付款。诺华公司使用一种或多种已经开发或正在使用CodeEvolver开发的酶生产的每一种原料药，该公司还有可能收到按数量计算的使用费，这些原料药是由诺华公司使用CodeEvolver开发的或正在开发的一种或多种酶生产的® 蛋白质工程平台技术自技术转让期限结束之日起至最后一项许可专利到期之日止。诺华使用CodeEvolver生产原料药的每个季度，诺华将向公司支付这些与产品相关的使用费(如果有的话®-开发酶。使用付费将基于使用CodeEvolver生产的API的总量®-开发酶。这些使用费可以从临床阶段开始，并将延续到每种原料药的整个商业寿命。合并的初始许可和技术转让履行义务的收入(预计将在27个月内发生)使用描述我们在转让服务控制权方面的绩效的单一进度衡量标准进行确认，该衡量标准基于迄今产生的努力水平与完成与合并的初始许可和技术转让相关的履行义务所需的总估计努力水平的比率。分配给未来改善的收入将在改善期内确认。我们认识到30万美元 和 110万美元截至2021年6月30日的三个月和六个月的研发收入分别为90万美元和370万美元，而截至2020年6月30日的三个月和六个月的研发收入分别为90万美元和370万美元。
战略协作和许可协议
2020年3月，我们与武田制药有限公司(“武田”)的全资子公司夏尔人类基因治疗公司(Shire Human Genetic Treatations，Inc.)签订了武田协议，根据该协议，我们正在合作研究和开发用于某些疾病的基因治疗产品的蛋白质序列。在执行武田协议时，我们收到了850万美元的预付现金，不可退还。与提供给武田的功能性许可证有关的收入在许可证控制权移交给客户时确认。2021年5月，武田选择行使他们的选择权，为某种未披露的罕见遗传疾病启动一个额外的计划；因此，我们有资格获得选择权行使费。
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武田公司可能支付的其他款项包括：(I)报销三个初始计划的研发费用和临床前开发里程碑，总计1540万美元；(Ii)每个目标基因的临床开发和基于商业化的里程碑，最高可达1.00亿美元；(Iii)根据适用产品的净销售额，按中位数-个位数到低个位数的百分比分级支付特许权使用费。我们确认了与武田协议有关的研发收入。210万美元和420万美元或截至2021年6月30日的三个月和六个月，相比之下，截至2020年6月30日的三个月和六个月分别为570万美元和800万美元。
经营成果
下表显示了我们未经审计的合并简明营业报表中的金额(除百分比外，以千计)：
 截至6月30日的三个月，变化截至6月30日的六个月，变化
 20212020$%20212020$%
收入：
产品收入$14,717 $4,504 $10,213 227%$24,943 $9,604 $15,339 160%
研发收入10,736 10,463 273 3%18,542 20,033 (1,491)(7)%
总收入25,453 14,967 10,486 70%43,485 29,637 13,848 47%
成本和运营费用：
产品收入成本4,318 1,699 2,619 154%8,536 4,240 4,296 101%
研发12,826 10,853 1,973 18%24,397 21,820 2,577 12%
销售、一般和行政12,795 8,522 4,273 50%24,193 17,512 6,681 38%
总成本和运营费用29,939 21,074 8,865 42%57,126 43,572 13,554 31%
运营亏损(4,486)(6,107)1,621 27%(13,641)(13,935)294 2%
利息收入206 57 149 261%382 323 59 18%
其他收入(费用)，净额23 13 10 (77)%(63)(72)9 13%
所得税前亏损(4,257)(6,037)1,780 29%(13,322)(13,684)362 3%
所得税拨备8 307 (299)(97)%11 312 (301)(96)%
净损失$(4,265)$(6,344)$2,079 33%$(13,333)$(13,996)$663 5%
收入
我们的收入包括产品收入和研发收入，具体如下：
•产品收入包括生物催化剂、医药中间体和食典的销售。®生物催化剂面板和套件。
•研发收入包括许可费、技术访问费和排他费、研究服务费、里程碑付款、特许权使用费、优化和筛选费用。
收入如下(除百分比外，以千计)：
截至6月30日的三个月，变化截至6月30日的六个月，变化
20212020$%20212020$%
产品收入$14,717 $4,504 $10,213 227%$24,943 $9,604 $15,339 160%
研发收入10,736 10,463 273 3%18,542 20,033 (1,491)(7)%
总收入$25,453 $14,967 $10,486 70%$43,485 $29,637 $13,848 47%
由于我们客户的生产计划和客户临床试验时间的变化，收入通常会在季度基础上波动。此外，我们生产酶的内部能力有限。因此，我们依赖第三方制造商的性能和能力来实现我们制药和精细化学品业务中使用的酶的商业规模生产。
我们接受从下订单之日起一天到大约14个月的订购单。但是，大多数采购订单可以由客户修改或取消，而无需
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处罚。考虑到这些行业惯例和我们的经验，我们认为未完成的客户采购订单总数(积压)不能提供有意义的信息，可用于预测未来期间的实际销售额。
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月和六个月的总收入分别增加了1050万美元和1380万美元，这主要是由于产品收入增加，但部分被这六个月研发收入的下降所抵消。
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月和六个月的产品收入分别增加了1020万美元和1530万美元，这主要是由于客户对品牌医药产品的需求增加。我们预计今年剩余时间对我们产品的需求将高于去年同期，主要是因为对品牌医药产品制造中使用的酶的总体需求较高，以及我们在2021年6月从一家制药客户那里收到的价值1390万美元的专有高酶产品的大笔采购订单，该订单将在随后的几个时期确认为收入。
与截至2020年6月30日的三个月相比，截至2021年6月30日的三个月研发收入增加了30万美元，达到1070万美元，这主要是由于现有协作协议的许可费上涨。与截至2020年6月30日的6个月相比，截至2021年6月30日的6个月的研发收入减少了150万美元，降至1850万美元，主要原因是武田根据上一年同期确认的武田协议支付了更高的许可和研发费用，但这部分被其他现有合作协议的更高许可费用所抵消。
成本和运营费用
我们的成本和运营费用包括产品收入成本、研发费用、销售费用、一般费用和行政费用。下表显示了我们未经审计的简明综合经营报表中的产品收入、研发费用、销售、一般和管理费用的金额(除百分比外，以千为单位)：
截至6月30日的三个月，变化截至6月30日的六个月，变化
20212020$%20212020$%
产品收入成本$4,318 $1,699 $2,619 154%$8,536 $4,240 $4,296 101%
研发12,826 10,853 1,973 18%24,397 21,820 2,577 12%
销售、一般和行政12,795 8,522 4,273 50%24,193 17,512 6,681 38%
总成本和运营费用$29,939 $21,074 $8,865 42%$57,126 $43,572 $13,554 31%
产品收入成本和产品毛利率
我们的产品收入完全来自我们的性能酶部门。新型生物疗法部门的收入来自合作研究和开发活动，而不是产品收入。
下表显示了我们的产品收入、产品收入成本、产品毛利和我们未经审计的简明综合经营报表中的产品毛利的金额(千元，除百分比外)：
截至6月30日的三个月，变化截至6月30日的六个月，变化
20212020$%20212020$%
产品收入$14,717$4,504$10,213 227%$24,943$9,604$15,339 160%
产品收入成本(1)
4,3181,6992,619 154%8,5364,2404,296 101%
产品毛利$10,399$2,805$7,594 271%$16,407$5,364$11,043 206%
产品毛利率(%)(2)
71 %62 %66 %56 %
(1) 产品收入成本包括内部和第三方固定和可变成本，包括材料和用品、劳动力、设施和其他与产品收入相关的间接成本。
(2) 产品毛利率被用作业绩衡量标准，以提供有关我们在综合基础上的经营结果的更多信息。
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与截至2020年6月30日的三个月相比，截至2021年6月30日的三个月的产品收入成本增加了260万美元，与截至2020年6月30日的六个月相比，截至2021年6月30日的六个月增加了430万美元。这一增长主要是由于产品销售量的增加和产品组合的变化。在截至2021年6月30日的三个月和六个月，产品毛利率分别增至71%和66%，而截至2020年6月30日的三个月和六个月的产品毛利率分别为62%和56%，这主要是由于销售利润率更高的品牌产品。
研发费用
研发费用包括内部项目和合作研发活动的成本。这些费用主要包括：(I)与雇员有关的费用，包括工资和其他与人事有关的费用(包括股票薪酬)；(Ii)各种可分配费用，包括与占用有关的费用、用品、设施和实验室设备的折旧，以及(Iii)外部费用。研究和开发费用在发生时计入。
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月研发费用增加了200万美元，增幅为18%；截至2021年6月30日的六个月，研发费用增加了260万美元，增幅为12%。研究和开发费用的增加主要是由于员工人数增加、实验室用品增加、折旧和其他外部服务导致的成本增加，但与CMC和监管费用相关的外部服务成本的下降部分抵消了这一增加。我们预计今年剩余时间的研发费用将高于上年同期，这主要是由于员工人数的增加，以及我们继续努力推进我们的内部和合作计划。
销售、一般和行政费用
销售、一般和行政费用包括与员工相关的成本，其中包括工资和其他与人员相关的费用(包括股票薪酬)、招聘和培训费用、咨询和外部服务费用(包括审计和法律顾问相关费用)、营销成本、建筑租赁成本以及折旧和摊销费用。
在截至2021年6月30日的三个月中，销售、一般和行政费用增加了430万美元，增幅为50%；与2020年同期相比，截至2021年6月30日的六个月增加了670万美元，增幅为38%。这一增长主要是由于与更多员工相关的成本增加、法律费用增加以及基于股份的薪酬成本增加，但部分被较低的差旅和可分配费用所抵消。我们预计今年剩余时间的销售、一般和行政费用将高于上年同期，主要原因是员工人数增加，运营成本上升因为我们增加了对业务的投资，以追求未来的增长机会。
利息收入和其他收入(费用)，净额(以千为单位，百分比除外)：
截至6月30日的三个月，变化截至6月30日的六个月，变化
20212020$%20212020$%
利息收入$206 $57 $149 261%$382 $323 $59 18%
其他收入(费用)，净额23 13 10 (77)%(63)(72)9 13%
其他收入合计$229 $70 $159 227%$319 $251 $68 27%
利息 收入
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月和六个月的利息收入分别增加了149.0和5.9万美元，这主要是由于赚取的利息收入和非市场债务证券的债务折价摊销，部分被平均现金余额下降的平均利率下降带来的利息收入减少所抵消。
其他收入(费用)，净额
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月和六个月的其他收入(费用)净值分别增加了10000美元和90000美元，这主要是由于非上市证券的股票结算赎回功能的嵌入式分叉衍生品的摊销确认的利息支出，部分被上一年减记我们在CO的40万美元投资所抵消2解决方案和外币波动。
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所得税拨备(以千为单位，百分比除外)：
截至6月30日的三个月，变化截至6月30日的六个月，变化
20212020$%20212020$%
所得税拨备$8 $307 $(299)(97)%$11 $312 $(301)96 %
截至2021年6月30日的三个月和六个月的所得税拨备主要是由于历史上不确定的税收状况的利息和罚款的应计费用。我们确认了截至2020年6月30日的三个月和六个月的所得税拨备，用于外国税务机关对在美国以外某些国家赚取并汇回美国的收入预扣所得税。
净亏损
截至2021年6月30日的三个月净亏损为430万美元，或每股基本稀释后净亏损0.07美元。相比之下，截至2020年6月30日的三个月净亏损630万美元，或每股基本稀释后净亏损0.11美元。截至2021年6月30日的6个月净亏损为1330万美元，或每股基本和稀释后净亏损0.21美元。相比之下，截至2020年6月30日的6个月，净亏损1400万美元，或每股基本稀释后净亏损0.24美元。截至2021年6月30日的三个月和六个月净亏损的减少主要是由于产品收入的增加和更高的利润率，但部分被更高的运营费用和更低的研发收入所抵消。
按细分市场划分的运营结果(以千为单位，百分比除外)：
按细分市场划分的收入
截至6月30日的三个月，变化
20212020性能酶新型生物疗法
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计$%$%
收入：
产品收入$14,717 $— $14,717 $4,504 $— $4,504 $10,213 227 %$— — %
研发收入6,868 3,868 10,736 3,002 7,461 10,463 3,866 129 %(3,593)(48)%
总收入$21,585 $3,868 $25,453 $7,506 $7,461 $14,967 $14,079 188 %$(3,593)(48)%
截至6月30日的六个月，变化
20212020性能酶新型生物疗法
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计$%$%
收入：
产品收入$24,943 $— $24,943 $9,604 $— $9,604 $15,339 160 %$— — %
研发收入10,872 7,670 18,542 8,775 11,258 20,033 2,097 24 %(3,588)(32)%
总收入$35,815 $7,670 $43,485 $18,379 $11,258 $29,637 $17,436 95 %$(3,588)(32)%
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月，性能酶部门的收入增加了1410万美元，增幅为188%；截至2021年6月30日的六个月，性能酶部门的收入增加了1740万美元，增幅为95%，这主要是由于产品和研发收入的增加。与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月的产品收入增加了1020万美元，增幅为227%；截至2021年6月30日的六个月的产品收入增加了1530万美元，增幅为160%，这主要是由于客户对用于生产品牌药物产品的酶的需求增加。在截至2021年6月30日的三个月里，研发收入增加了390万美元，增幅为129%，达到690万美元，而截至2020年6月30日的三个月的研发收入为300万美元，这主要是由于波顿根据波顿协议支付的年度协作费和研发收入。在截至2021年6月30日的六个月里，研发收入增加了210万美元，增幅为24%，达到1090万美元。
39

在截至2020年6月30日的6个月中，收入达到880万美元，主要是因为现有合作协议的许可费较高，但部分被诺华CodeEvolver下诺华公司收入下降所抵消®协议。
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月，新型生物疗法部门的收入减少了360万美元，降幅为48%；截至2020年6月30日的六个月，新型生物疗法部门的收入减少了360万美元，降幅为32%，这主要是由于根据上一年认可的武田协议，武田的许可证和研发费用增加，以及雀巢健康科学的研发收入下降。
按细分市场划分的成本和运营费用
截至6月30日的三个月，变化
20212020性能酶新型生物疗法
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计$%$%
产品收入成本$4,318 $— $4,318 $1,699 $— $1,699 $2,619 154 %$— — %
研发(1)
5,057 7,194 12,251 4,997 5,490 10,487 60 1 %1,704 31 %
销售、一般和行政(1)
3,170 620 3,790 2,375 621 2,996 795 33 %(1)— %
部门总成本和运营费用$12,545 $7,814 20,359 $9,071 $6,111 15,182 $3,474 38 %$1,703 28 %
企业成本(2)
8,839 5,386 
未分配折旧和摊销741 506 
总成本和运营费用$29,939 $21,074 

截至6月30日的六个月，变化
20212020性能酶新型生物疗法
性能酶新型生物疗法总计性能酶新型生物疗法总计$%$%
产品收入成本$8,536 $— $8,536 $4,240 $— $4,240 $4,296 101 %$— — %
研发(1)
11,502 11,799 23,301 10,693 10,415 21,108 809 8 %1,384 13 %
销售、一般和行政(1)
5,988 1,221 7,209 4,720 1,213 5,933 1,268 27 %8 1 %
部门总成本和运营费用$26,026 $13,020 39,046 $19,653 $11,628 31,281 $6,373 32 %$1,392 12 %
企业成本(2)
16,654 11,293 
未分配折旧和摊销1,426 998 
总成本和运营费用$57,126 $43,572 
(1) 研发费用和销售、一般和行政费用不包括融资租赁的折旧和摊销。
(2) 公司成本包括未分配的销售费用、一般费用和行政费用。
有关收入的产品成本的讨论，请参阅“经营成果".
与2020年同期相比，截至2021年6月30日的三个月，性能酶部门的研发费用名义上增加了6万美元，增幅为1%；截至2021年6月30日的六个月，研发费用增加了80万美元，增幅为8%。增加的主要原因是与外部服务、实验室用品相关的成本增加以及员工人数增加。部分被较低的可分配费用所抵消.
在截至2021年6月30日的三个月里，性能酶部门的销售、一般和管理费用增加了80万美元，增幅为33%，而在截至2021年6月30日的六个月里，性能酶部门的销售、一般和管理费用增加了130万美元，增幅为27%
40

2020年同期。这一增长主要是由于与更多员工相关的成本增加所致以及较高的可分配费用，但部分被较低的外部服务费用所抵消。
与2020年同期相比，在截至2021年6月30日的6个月里，新型生物疗法部门的研发费用增加了170万美元，增幅为31%，增加了140万美元，增幅为13%。这一增长主要是由于与更多员工和可分配费用相关的成本增加所致。
截至2021年6月30日的3个月和6个月，新型生物疗法部门的销售、一般和管理费用与截至2020年6月30日的3个月和6个月相比保持不变。
流动性与资本资源
流动性是衡量我们满足营运资本需求和为资本支出提供资金的能力。从历史上看，我们主要通过运营产生的现金、行使股票期权以及公开和非公开发行我们的普通股来为我们的业务提供资金。我们也有能力在我们的信贷安排下借到最多1500万美元。我们积极管理我们的现金使用和流动现金的投资，以确保保持足够的资金来满足我们的营运资金需求。我们的现金和现金等价物存放在美国的银行。
以下汇总了我们截至2021年6月30日和2020年12月31日的现金和现金等价物余额和营运资金(单位：千)：
2021年6月30日2020年12月31日
现金和现金等价物$129,506 $149,117 
营运资金$148,305 $159,442 
除了我们现有的现金和现金等价物外，我们还有资格赚取里程碑付款和其他或有付款，以实现我们的协作协议规定的协作目标和某些版税付款。我们赚取这些里程碑和或有付款的能力以及实现这些里程碑的时间主要取决于我们合作者的研发活动的结果，目前还不确定。2016年，我们完成了CodeEvolver转移的最后阶段®默克代码演变下的默克技术® 协议。在完成向默克公司的技术转让后，我们现在有资格为默克公司使用CodeEvolver开发的一种或多种新型酶生产的每一种商业原料药获得最高1500万美元的付款®技术此外，根据葛兰素史克对许可技术的成功应用，我们有可能获得每个项目从575万美元到3850万美元不等的额外或有付款。
2019年5月，我们进入诺华CodeEvolver® 与诺华公司达成协议。诺华公司的CodeEvolver®协议允许诺华公司使用Codexis的专有CodeEvolver® 蛋白质工程平台技术在人类保健领域的应用。根据协议，我们在诺华CodeEvolver生效日期后不久收到了500万美元的预付款® 协议。在2020年第二季度，我们根据协议完成了第二次里程碑式的技术转让，并有资格获得一笔里程碑式的付款400万美元，我们随后在2020年7月收到。在2021年第一季度，我们还收到了340万美元部分完成第三个技术里程碑。另外，我们还会收到一份额外的160万美元在令人满意地完成2021年7月发生的第三个技术转让里程碑之后。考虑到在技术转让期限(“改进期限”)结束后的多年期间内继续披露和许可对我们技术和材料的改进，诺华公司将每年向Codexis支付相当于额外费用的款项。总计800万美元.
2017年10月，我们与雀巢健康科学签订了雀巢许可协议。根据雀巢许可协议，雀巢健康科学公司在首次人类1a期剂量递增试验中使用CDX-6114给首批受试者配药并获得与CDX-6114相关的配方后，向我们支付了预付现金付款和里程碑付款。2019年1月，我们收到FDA的通知，它已经完成了对我们针对CDX-6114的IND的审查，并得出结论，我们可能会继续在美国健康志愿者中进行拟议的1b期多次递增剂量研究。2019年2月，雀巢健康科学行使其选择权，获得了CDX-6114在全球范围内的独家、特许权使用费、可再许可的许可，用于管理PKU的CDX-6114的全球开发和商业化。在行使选择权后，雀巢健康科学公司支付了选择权，并承担了CDX-6114未来临床开发和商业化的所有责任，但在2019年第四季度基本完成的延伸研究除外。雀巢健康科学根据雀巢许可协议向我们支付的其他潜在款项包括：(I)开发和审批里程碑，金额高达8500万美元；(Ii)基于销售的里程碑，总额高达2.5亿美元，如果一年的净销售额超过10亿美元，则可实现总额；以及(Iii)产品净销售额的分级特许权使用费，百分比从中位数的个位数到较低的两位数不等。
41

我们正在积极与制药和食品行业的新老客户合作。我们相信，我们可以利用我们现有的产品和服务，并开发新的产品和服务，以增加我们未来的收入和毛利率。
随着我们继续投资于关键技术开发项目和对CodeEvolver的改进，我们历来经历了运营现金流为负的情况®蛋白质工程技术平台，并扩大我们的业务开发和与新客户的合作。我们的运营现金流将继续主要受到向主要制药公司授权我们的技术的销售、产品销售和产品毛利率、向客户提供的协作研发服务以及我们的员工成本(主要是研发成本)的影响。我们经营活动的主要现金流来源是客户的现金收入，用于购买产品、合作研究和开发服务，以及将我们的技术授权给主要制药公司。我们经营活动中最大的现金用途是与员工相关的支出、租金支付、购买库存以支持我们的产品销售和非工资研发成本。
股权分配协议
2021年5月，我们与派珀·桑德勒公司(Piper Sandler&Co)签订了一项股权分配协议(“EDA”)，根据该协议，派珀·桑德勒公司作为我们的独家代理，可在协议签署之日起的三年内出售最多5000万美元的普通股。在截至2021年6月30日的六个月内，没有根据EDA发行我们的普通股。截至2021年6月30日，根据EDA，仍有5000万美元的股票可用。根据这一安排，我们普通股的销售可能会受到商业、经济或竞争方面的不确定性和意外事件的影响，其中许多可能是我们无法控制的，这可能会导致出售我们普通股的实际结果与预期大不相同。有关信息，请参阅本季度报告(Form 10-Q)中未经审计的简明综合财务报表附注中的注释9，“股本”。
股票发行
2020年12月，我们完成了约4928,572股普通股的包销公开发行，每股票面价值0.0001美元，公开发行价为每股17.5美元。扣除发售成本以及550万美元的承销折扣和佣金以及其他发售费用后，我们获得的净收益约为8080万美元。
信贷安排
2017年6月30日，我们与西联银行签订了信贷安排，其中包括定期贷款，使我们能够借入最多1000万美元，并根据循环安排，允许我们借入最多500万美元，符合条件的应收账款借款基数为合格应收账款的80%。2020年9月，我们达成了信贷安排的第八项修正案，根据该修正案，我们可以分别在2021年10月1日和2024年10月1日之前的任何时间动用定期债务和循环信贷额度，但要遵守融资的惯例条件，其中包括不存在违约事件。信贷工具的提款以对我们除知识产权以外的几乎所有个人财产的留置权为担保。2024年10月1日，根据定期债务提取的贷款到期，循环信用额度终止。截至2021年6月30日和2020年12月31日，信贷安排下没有提取任何金额。截至2021年6月30日，我们遵守了信贷安排的契约。信贷安排要求我们遵守某些金融契约，包括达到某些贷款人批准的预测或维持某些最低现金水平。信贷安排中的限制性契约限制股息或其他分配的支付。有关我们合同义务的更多信息，请参阅本季度报告Form 10-Q中未经审计的简明综合财务报表附注中的附注10“承诺和或有事项”。
截至2021年6月30日，我们在信贷安排下可借入的现金和现金等价物分别为1.295亿美元和1500万美元。我们的流动性取决于我们的现金和现金等价物、经营活动提供的现金流以及我们信贷安排下借款的持续可用性。
我们相信，根据我们目前的运营水平，我们现有的现金和现金等价物将为持续运营、计划的资本支出和至少未来12个月的营运资本需求提供充足的资金。
然而，如果我们目前的计划和假设发生变化，我们可能需要额外的资本。此外，我们可能会选择寻找其他资本来源，即使我们认为我们已经产生了足够的现金流来支持我们的运营需求。我们对额外资本的需求将取决于许多因素，包括我们业务的财务成功，开发和商业化新产品和现有产品所需的支出，以及任何收购其他业务、技术或设施的影响
42

如果有必要，我们可能会在未来制定或开发新的市场机会，以及提交、起诉、执行和辩护专利主张的潜在成本。如果我们的资本资源不足以满足我们的资本要求，并且我们无法与能够或愿意为我们的开发工作提供资金或将我们开发或启用的任何产品商业化的合作伙伴建立或保持合作，我们将不得不筹集额外的资金来继续开发我们的技术和产品，并完成由我们的技术产生的产品(如果有的话)的商业化。如果未来的融资涉及发行股权证券，我们现有的股东将受到稀释。如果我们筹集债务融资或进行信贷安排，我们可能会受到限制性契约的限制，这些契约限制了我们开展业务的能力。我们可能无法以对我们有利的条款筹集足够的额外资金，如果有的话。如果我们不能筹集足够的资金，不能产生足够的收入来实现计划的毛利率和控制运营成本，我们为我们的运营提供资金、利用战略机遇、开发产品或技术或以其他方式应对竞争压力的能力可能会受到极大限制。如果发生这种情况，我们可能被迫推迟或终止研究或开发计划或由我们的技术产生的产品的商业化，减少或停止运营，或通过可能要求我们放弃商业权或以对我们不利的条款授予许可的合作和许可安排获得资金。如果没有足够的资金，我们将无法成功执行我们的业务计划或继续我们的业务。
现金流
以下为截至2021年6月30日和2020年6月30日的六个月现金流量摘要(单位：千)：
 截至6月30日的六个月，
20212020
用于经营活动的现金净额$(14,735)$(11,498)
用于投资活动的净现金(4,945)(2,490)
融资活动提供(用于)的现金净额473 (903)
现金、现金等价物和限制性现金净减少$(19,207)$(14,891)
经营活动的现金流
截至2021年6月30日的6个月，经营活动中使用的现金为1470万美元，这是由于截至2021年6月30日的6个月净亏损1330万美元，经折旧的非现金费用调整后为140万美元，净收益租赁资产摊销支出为130万美元，基于股票的薪酬为550万美元，部分被从研发活动中赚取的股权证券抵消。营业资产和负债变化使用的额外现金为880万美元。营业资产和负债的变化包括其他长期负债减少130万美元，应计补偿和其他应计负债减少40万美元，金融资产增加750万美元，但被递延收入增加30万美元和应付帐款增加40万美元部分抵消。
截至2020年6月30日的6个月，经营活动中使用的现金为1150万美元，这是由于截至2020年6月30日的6个月净亏损1400万美元，经90万美元的折旧非现金费用、130万美元的ROU租赁资产摊销费用和410万美元的股票薪酬调整后的净亏损。营业资产和负债变化使用的额外现金为380万美元。营业资产和负债的变化包括未开账单应收账款减少230万美元和应收账款减少500万美元，但被递延收入增加300万美元和应计补偿和其他应计负债增加190万美元部分抵消。
投资活动的现金流
截至2021年6月30日和2020年6月30日的六个月，投资活动中使用的现金分别为490万美元和250万美元。截至2021年6月30日的6个月，用于投资活动的现金主要用于购买物业和设备430万美元，以及购买1,000,000股麦氏A系列优先股的60万美元。
在截至2020年6月30日的6个月中，投资活动中使用的现金主要是由于以100万美元购买了1,587,050股Mai的A系列优先股，以及150万美元用于购买房地产和设备。
融资活动的现金流
在截至2021年6月30日的6个月里，融资活动提供的现金为50万美元，主要归因于行使股票期权的170万美元收益，部分抵消了120万美元与股票奖励净股票结算相关的税款。
43

截至2020年6月30日的6个月，融资活动中使用的现金为90万美元，主要归因于与股权奖励的净股票结算相关的税款。
材料现金需求
下表汇总了截至2021年6月30日，与不可取消经营租赁项下的最低未来付款(不包括公共区域维护费和房地产税)相关的重大现金需求(以千为单位)：
按期到期付款
总计不到1年1至3年4至5年5年以上
经营租赁 (1)
$29,198 $4,156 $9,179 $9,738 $6,125 
经营租赁(2)
31,723 1,000 5,977 7,912 16,834 
总计$60,921 $5,156 $15,156 $17,650 $22,959 
(1)2019年第一季度，我们与大都会人寿签订了第八项租约修正案，延长租赁期限2027年5月至2029年5月，我们位于加利福尼亚州红杉城的设施。
(2) 2021年第一季度，我们与2021年RE-San Francisco No.63，LLC签订了为期10年的圣卡洛斯设施租约。
欲了解更多信息，请参阅本季度报告(Form 10-Q)中未经审计的简明综合财务报表附注中的附注10，“承付款和或有事项”。
其他材料现金需求
在正常业务过程中，我们还有其他与供应和服务安排有关的重要现金需求。有关其他重大现金需求的更多信息，请参阅本季度报告Form 10-Q中未经审计的简明综合财务报表附注中的附注10，“承付款和或有事项”。未来的最低付款反映了这些债务预计在未来一段时间内对我们的流动性和现金流产生的金额，并包括受到我们取消风险的债务(以千为单位)：
按协议类型列出的其他物料现金需求协议日期未来最低还款额
制造和供应协议，预计未来付款日期为2022年12月2016年4月$162 
开发和制造服务协议2019年9月1,852 
其他承付款总额$2,014 
我们临时承诺向第三方支付总计270万美元的潜在未来研发里程碑付款，用于临床应用和监管审批过程中实现的专利、许可和开发项目。付款一般只有在达到某些发展和管理里程碑时才到期和支付，具体时间无法预测。某些协议还规定了总计60万美元的以销售为基础的里程碑，我们有义务在达到一定的销售水平后支付特许权使用费。
我们没有使用特殊目的融资工具，也没有未披露的表外安排。
关键会计政策和估算
按照公认会计原则编制财务报表要求管理层在编制综合财务报表和附注时作出判断、估计和假设。实际结果可能与这些估计不同。在截至2021年6月30日的三个月和六个月里，我们的关键会计政策或估计与我们于2021年3月1日提交给证券交易委员会的Form 10-K年度报告中讨论的那些相比没有实质性变化。
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第三项。关于市场风险的定量和定性披露

市场风险管理
由于外币汇率、利率和其他因素的变化，我们的现金流和收益都会受到波动的影响。这些市场风险敞口在我们于2021年3月1日提交给SEC的截至2020年12月31日的年度报告Form 10-K的第II部分第7A项中披露。
利率敏感度
截至2021年6月30日，我们的无限制现金和现金等价物总额为1.295亿美元。我们主要将这些资金投资于货币市场基金，这些基金是为营运资金目的而持有的。我们不以交易或投机为目的进行投资。截至2021年6月30日，假设市场利率下降10%的效果将对未来利息收入和现金流的潜在损失产生非实质性影响。
2017年6月，我们与西联银行签署了一项信贷安排，包括1000万美元的定期贷款和500万美元的循环信贷额度预付款。定期债务项下的定期贷款在到期时按浮动利率计息，利率为(I)3.75%或(Ii)(A)指数利率(最优惠利率)加(B)0.50%，两者之和为(A)指数利率(最优惠利率刊登在华尔街日报西部版的货币利率部分)。循环信贷额度下的垫款计入浮动年利率，等同于(I)4.25%或(Ii)(A)最优惠利率加(B)1.00%之和，两者以较大者为准。这些浮动利率的增加将增加我们未来的利息支出，降低我们的经营业绩和现金流。截至2021年6月30日，信贷安排下没有提取任何金额。我们对利率风险的敞口与我们2017年的浮动利率信贷安排有关，在这种情况下，利率上升可能会导致更高的借款成本。由于截至2021年6月30日，我们2017年的信贷安排下没有未偿还的借款，假设利率变化10%的影响不会对我们的利息支出产生任何影响。
外币风险
由于外币汇率的变化，我们的经营业绩和现金流会受到波动的影响。虽然我们几乎所有的销售额都是以美元计价的，但未来美元价值的波动可能会影响我们产品在美国以外的价格竞争力。外币汇率变动对我们的业务和现金流的影响可能很难或不可能量化。
非流通性债权和股权证券投资
我们拥有非上市可供出售债务证券和非上市股权证券的投资，这些证券的公允价值不容易确定。为了分析这些债务证券的公允价值计量，我们使用重要的不可观察的输入进行定性分析。不可观察到的投入的重大变化可能会导致公允价值估计大幅上升或下降。
如果这些证券交易的条款与投资者和我们之间的证券交易条款基本相似，我们可能会根据最近与老练的非战略性无关投资者进行的重大公平股权交易来对这些股权证券进行估值。交易条款的差异对投资组合公司市值的影响可能很难或不可能量化。
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第四项。控制和程序

信息披露控制和程序的评估
我们维持信息披露控制、程序和内部控制，旨在提供合理的保证，确保在美国证券交易委员会的规则和表格规定的时间内记录、处理、汇总和报告我们的交易法报告中需要披露的信息，并将这些信息积累并传达给我们的管理层，包括我们的首席执行官和我们的首席财务和会计官，以便及时做出有关所需披露的决定。
我们的管理层，包括我们的首席执行官和首席财务会计官，评估了我们的披露控制和程序的有效性，这些控制和程序由交易法规则13a-15(E)和15d-15(E)定义。基于这一审查，我们的首席执行官和首席财务会计官得出结论，这些披露控制和程序截至2021年6月30日在合理保证水平下有效。
财务报告内部控制的变化
我们对财务报告的内部控制没有发生重大影响或合理地可能对我们的财务报告内部控制产生重大影响的变化，这些变化与交易法规则13a-15或15d-15的(D)段要求的评估有关。由于采用了新的准则，我们对财务报告的内部控制没有重大变化。
控制措施有效性的固有限制
在设计和评估披露控制和程序时，管理层认识到，任何控制和程序，即使被确定为有效的，无论设计和操作得多么好，也只能提供合理的保证，以实现预期的控制目标，以防止或发现错误陈述。此外，披露控制和程序的设计必须反映这样一个事实，即存在资源限制，要求管理层在评估可能的控制和程序相对于其成本的益处时作出判断。此外，对未来期间进行任何有效性评估的预测都有这样的风险，即由于条件的变化，控制措施可能会变得不充分，或者政策或程序的遵守程度可能会恶化。

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第二部分：其他信息
第一项。
法律程序

我们目前不是任何重大待决诉讼或其他重大法律程序的当事人。
项目1A。危险因素
我们在截至2020年12月31日的Form 10-K年度报告的第I部分第1A项中，描述了可能影响我们的业务、未来业绩或财务状况的某些风险和不确定因素(“风险因素”)。在截至2021年6月30日的三个月里，与截至2020年12月31日的Form 10-K年度报告中披露的风险因素相比，风险因素没有发生重大变化。投资者在就我们的股票做出投资决定之前，应考虑风险因素。

第二项。未登记的股权证券销售和收益的使用

没有。
第三项。
高级证券违约

没有。
第四项。煤矿安全信息披露

不适用。
第五项。其他信息

不适用。

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第6项。展品
3.1
Codexis，Inc.于2010年4月27日向特拉华州州务卿提交了修订和重新发布的公司注册证书，自2010年4月27日起生效(通过引用2010年5月28日提交的公司截至2010年3月31日的Form 10-Q季度报告的附件3.1并入本公司的公司注册证书中)，该证书已于2010年4月27日提交给特拉华州州务卿，并于2010年4月27日生效(通过引用2010年5月28日提交的公司截至2010年3月31日的Form 10-Q季度报告的附件3.1并入本公司)。
3.2
Codexis，Inc.于2012年9月4日提交给特拉华州州务卿的A系列初级参与优先股指定证书(通过参考2012年9月4日提交的公司当前8-K报表的附件3.1并入)。
3.3
自2010年4月27日起生效的Codexis，Inc.修订和重新修订的章程(通过参考2010年5月28日提交的公司截至2010年3月31日的Form 10-Q季度报告的附件3.2并入)。
4.1请参阅图3.1至3.3。
10.1
公司与派珀·桑德勒公司于2021年5月7日签订的股权分配协议(通过参考公司于2021年5月7日提交的8-K表格当前报告的附件1.1合并而成)。
31.1
根据修订后的1934年证券交易法第13a-14(A)和15d-14(A)条要求的首席执行官证书。
31.2
根据修订后的1934年证券交易法第13a-14(A)和15d-14(A)条要求的首席财务官证明。
32.1
1934年修订的《证券交易法》第13a-14(B)条和《美国法典》第18编第1350条规定的首席执行官和首席财务官认证。
101 
以下材料摘自公司截至2021年6月30日的Form 10-Q季度报告，采用内联可扩展商业报告语言(IXBRL)格式，包括：(I)截至2021年6月30日和2020年12月31日的未经审计的简明综合资产负债表；(Ii)截至2021年6月30日和2020年6月30日的未经审计的三个月和六个月的未经审计的简明综合经营报表；(Iii)截至2021年6月30日和2020年6月30日的未经审计的简明综合资产负债表；(Iii)截至2021年6月30日和2020年6月31日的未经审计的简明综合资产负债表；(Iii)截至2021年6月30日和2020年6月31日的未经审计的简明综合资产负债表。2021年和2020年及(V)未经审计简明合并财务报表附注。
101.SCH内联XBRL分类扩展架构文档
101.CAL内联XBRL分类扩展计算链接库文档
101.DEF内联XBRL分类扩展定义Linkbase文档
101.LAB内联XBRL分类扩展标签Linkbase文档
101.PRE内联XBRL分类扩展演示文稿Linkbase文档
104
本公司截至2021年6月30日的季度报告Form 10-Q的封面采用内联XBRL格式，包含在附件101中。
*由于遗漏的信息(I)不是实质性的，(Ii)如果公开披露，可能会对竞争造成伤害，因此用括号标记的展品部分已被省略。

48

签名
根据1934年证券交易法的要求，注册人已正式促使本报告由正式授权的以下签名者代表其签署。
Codexis，Inc.
日期：2021年8月6日由以下人员提供：/s/约翰·J·尼科尔斯
约翰·J·尼科尔斯
总裁兼首席执行官兼首席执行官
(首席执行官)
日期：2021年8月6日由以下人员提供：/s/罗斯·泰勒
罗斯·泰勒
高级副总裁兼首席财务官
(首席财务会计官)

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