2024年5月12日，深交所對牧原食品發佈了關於其2023年年度報告的問詢函。深交所在審查公司年度報告過程中，對一些事項提出了關注，主要集中在財務狀況、核心業務收入及成本、存貨價值等方面。
年度報告顯示，2023年，牧原股份歸母淨利潤出現42.63億元的虧損。截至2023年底，公司流動負債超過流動資產310.76億元，資產負債率提高至62.11%，同比增加了7.75個百分點。年末，公司透過還本續貸方式將原定於2023年底到期的124.33億元短期借款延期至2024年底。
報告還顯示，公司2023年實現營業收入1,108.61億元，同比下滑11.19%。其中，養殖業務營業收入1,082.24億元，同比下滑9.62%，而屠宰、肉食業務營業收入218.62億元，同比增長45.79%。貿易業務實現營業收入30.23億元，同比下滑45.13%。公司生豬養殖業務的成本因素有所改變，飼料結構與同行業存在差異。
與此同時，公司生物資產包括消耗性生物資產和生產性生物資產，總計賬面價值爲419.65億元，佔資產總額的21.48%。深交所要求牧原股份針對財務狀況、業務收入及成本、存貨價值等問題做出詳細解釋，並提請年審會計師覈查並發表意見。
除此之外，深交所還注意到，牧原股份2023財年與關聯方的採購交易金額爲34.92億元。公司需對這些交易的公允性、合理性進行證明，並披露如何減少關聯交易。牧原股份需在5月27日前提交相關文件，並公開披露。